Программа конференции
Международная конференция
«Математическая биология и биоинформатика»

ПРОГРАММА
X МЕЖДУНАРОДНОЙ КОНФЕРЕНЦИИ
«МАТЕМАТИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ И БИОИНФОРМАТИКА»
14-17 октября 2024 г., Пущино, Россия

    14 октября 2024, понедельник

  • 9.00 – 10.00 Регистрация участников (ауд. 219, ИМПБ РАН)

    Открытие конференции (конференц-зал, ИМПБ РАН)

  • 10.00 – 10.15 Член-корреспондент РАН Якобовский Михаил Владимирович. Открытие конференции

  • 10.15 – 10.30 Лахно Виктор Дмитриевич. Юбилейная конференция ICMBB24

  • 10.30 – 11.10 Шайтан Константин Вольдемарович. Физические принципы формирования пространственной структуры биополимеров

    11.10 – 11.30 Перерыв

    Утреннее заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)

  • 11.30 – 12.05 Устинин Михаил Николаевич, Бойко А.И., Рыкунов С.Д. Функциональная томография сложных систем с помощью спектрального анализа данных многоканальных измерений

  • 12.05 – 12.40 Твердислов Всеволод Александрович. Молекулярные машины: симметрийные основы структуры и функций

  • 12.40 – 13.15 Наймарк Олег Борисович. Динамика открытых комплексов и дифференциация фенотипов клеток в условиях микрогравитации

  • 13.15 – 13.50 Лахно Виктор Дмитриевич. Динамика квантового клеточного автомата на основе квадруплексов ДНК

    13.50 – 15.00 Перерыв на обед

    Секция А Математические основы нанобиоэлектроники (конференц-зал, ИМПБ РАН)

  • 15.00 – 15.25 Фиалко Надежда Сергеевна, Лахно В.Д. Охлаждение полинуклеотида в модели Холстейна

  • 15.25 – 15.50 Коршунова Алевтина Николаевна, Лахно В.Д. Динамика холстейновского полярона под воздействием внешнего постоянного и переменного электрических полей

  • 15.50 – 16.15 Коршунова Алевтина Николаевна, Лахно В.Д. Внутренняя динамика холстейновского полярона в зависимости от начального поляронного состояния

  • 16.15 – 16.40 Фиалко Надежда Сергеевна, Лахно В.Д. Блоховские осцилляции в цепочке с температурой

  • 16.40 – 17.05 Шигаев Алексей С., Лахно В.Д. Исследование равновесной кинетики нуклеации пузырьков денатурации в модели ПБД при физиологических температурах


    15 октября 2024, вторник

    Утреннее заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)

  • 10.00 – 10.35 Дюк Вячеслав Анатольевич. Сравнение логических методов машинного обучения в задаче прогнозирования характера ремиссии у больных бронхиальной астмой

  • 10.35 – 11.10 Никитюк Александр Сергеевич. Моделирование процесса индентирования клетки с постоянной скоростью на основе статистико-термодинамического подхода

  • 11.10 – 11.45 Богатырев Михаил Юрьевич. Чем инспирированы биоинспирированные алгоритмы

    11.45 – 12.15 Перерыв

  • 12.15 – 12.50 Озолинь Ольга Николаевна. Негеномные последовательности в транскриптомах и РНК- секретомах бактерий: алгоритмы поиска и биологическая роль

  • 12.50 – 13.25 Чемерис Алексей Викторович. ДНК – поистине цифровая молекула

    13.45 – 15.00 Перерыв на обед


    Дневное заседание, секционные доклады

    Секция А «Математические модели наноструктур и биомолекул» (конференц-зал, ИМПБ РАН)

  • 15.00 – 15.25 Лихачев Илья Вячеславович, Балабаев Н.К. Анализ плавления ДНК в полноатомной модели

  • 15.25 – 15.50 Лихачев Илья Вячеславович, Балабаев Н.К., Быстров В.С. Влияние замены ионов кальция на ионы железа на плотность гидроксиапатита

  • 15.50 – 16.15 Русаков Алексей Вячеславович, Тихонов Д.А. Вариативность пространственно- временных структур в цепочке связанных логистических осцилляторов

    16.15 – 16.30 Перерыв

  • 16.30 – 16.55 Сидорова Алла Эдуардовна, Левашова Н.Т. Применение теории активных сред для моделирования развития урбоэкосистем

  • 16.55 – 17.20 Быстров Владимир Сергеевич, Парамонова Е.В., Леденева О.Р., Зеленовский П.С. Моделирование взаимодействия пептидных нанотрубок дифенилаланина с молекулами Methylene blue при поверхностно-усиленной рамановской спектроскопии

    17.20 – 17.40 Перерыв


    Дневное заседание, секционные доклады

    Секция Б «Биоинформатика» (ауд. 306, ИМПБ РАН)

  • 15.00 – 15.25 Чалей Мария Борисовна, Кутыркин В.А. Оптимизация распознавания подрода коронавирусов на основе N-генов прототипных штаммов

  • 15.25 – 15.50 Петрова Татьяна Евгеньевна, Джус У.Ф., Зюркалова Д. В., Глухов А.С., Курочкина Л.П., Габдулхаков А.Г. Использование моделей, предсказанных нейросетью AlphaFold, для определения структуры шаперонина бактериофага OBP

  • 15.50 – 16.15 Дюкова Анастасия Петровна, Дюкова Е.В. О методах машинного обучения в задаче предсказания промоторов

    16.15 – 16.30 Перерыв

  • 16.30 – 16.55 Руднев Владимир Ремович, Никольский К.С., Куликова Л.И., Петровский Д.В., Кайшева А.Л. SH3-домен, 3α-пучок и 3β-уголок: автономно стабильные структурные мотивы

  • 16.55 – 17.20 Петровский Денис Витальевич, Никольский К.С., Куликова Л.И., Руднев В.Р., Кайшева А.Л. Модель BERT в секвенировании белков de novo с использованием тандемных масс- спектров

    17.20 – 17.40 Перерыв

  • 17.40 – 18.05 Панкратов Антон Николаевич, Панкратова Н.М. Распознавание повторов в белках на основе спектрального подхода и методов конструктивной аппроксимации

  • 18.05 – 18.30 Панкратова Наталья Михайловна, Панкратов А.Н. Определение изменений метаболизма в плазме крыс с саркомой М1 в данных 1H-ЯМР-спектроскопии


    Постерная сессия (стендовые доклады)(холл 3-го этажа, ИМПБ РАН)

  • Быков Георгий Александрович, Пантелеев М.А. Глобальные и локальные изменения гемодинамики при венепункции

  • Божко Анастасия Алексеевна, Пантелеев М.А. Математическая модель мембранно-зависимой активации фактора свёртывания Х

  • Сааде Масуд. Модели эпидемической задержки развития инфекции

  • Фурлетова Евгения Игоревна. Оптимизация алгоритма SufPref вычисления P-значения вхождений образцов. Минимизация графа перекрытий

  • Иванова Полина Романовна, Вервейко Д.В., Браже А.Р., Верисокин А.Ю. Влияние нейротрансмиттеров на нейрональную активность в модели нейроглиоваскулярной единицы

  • Луценко А.О., Сидорова А.Э. Метод оценки хиральности надвторичных белковых структур

  • Шпигун Д.К., Сидорова А.Э., Левашов П.А. Связь хиральности спиральных структур с физическими характеристиками лизоцимов

  • Бойко Анна Ивановна, Устинин М.Н., Рыкунов С.Д. Открытые репозитории данных энцефалографии


    Заочные доклады

  • Mondal S., Sengupta S., Lahiri Ansuman On the Prediction of Folding and Stability of Quadruplexes

  • Москаленко Андрей Витальевич, Махортых С.А. Бифуркационное пятно в двумерной версии модели Алиева–Панфилова

  • Мирошниченко Любовь Александровна, Гусев В.Д. Профили сложности геномов сальмонелл

  • Слузова Наталья Александровна. Методика расчета экономического коэффициента в популяционной модели роста биомассы водорослей

  • Воропаева Ольга Фалалеевна. Иерархический подход в математическом моделировании динамики иммунной и болевой реакции на асептическое повреждение

  • Васильева Ирина Ивановна, Дружинина О.В., Масина О.Н.Построение и численный анализ популяционных динамических моделей с учетом конкуренции и миграции видов

  • Боженко В.К., Кулинич Татьяна Михайловна, Кудинова Е.А., Иванов А.В., Шишкин А.М., Солодкий В.А. Оптимизация пептидной последовательности с применением методов анализа энергии взаимодействия для получения перспективных противоопухолевых препаратов

  • Панюков Валерий Васильевич, Озолинь О.Н., Киселев С.С. Вариации нуклеотидного состава и отклонения от второго правила Чаргаффа в бактериальных хромосомах

  • Романов Михаил Сергеевич, Мастеров В.Б. Щадящий метод оценки дистанции вспугивания птиц с использованием цензурированных данных

  • Иванова Наталья Владимировна, Шашков М.П., Созонтов А.Н., Филиппова Н.В., Ермолов С.А., Соколова?С.С., Устинова?А.Л., Плакхина?Е.В. Опыт реализации региональных проектов оцифровки литературного наследия


    16 октября 2024, среда

    Утреннее заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)

  • 10.00 – 10.30 Кулеш Виктория Сергеевна, Песков К.В., Бочаров Г.А. Математическое исследование возрастных изменений гомеостаза Т-лимфоцитов человека

  • 10.30 – 11.00 Никитич Антонина Алексеевна, Песков К.В., Бочаров Г.А. Исследование иммунного ответа при инфекции вирусом LCMV с помощью математического моделирования

  • 11.00 – 11.30 Угольков Ярослав Александрович, Волкова А.А., Песков К.В., Соколов В.В. Системно-фармакологическая модель В-клеточного иммунитета в системной красной волчанке

    11.30 – 12.00 Перерыв

  • 12.00 – 12.30 Киреев Борис Владимирович, Никитич А.А., Соколов В.В., Песков К.В., Волкова А.А. Разработка системной фармакологической модели иммунных процессов заболевания дерматомиозит для поиска новых мишеней и разработки препаратов

  • 12.30 – 13.00 Даничкина Ксения Викторовна, Жуденков К.В. Сравнительный анализ методов извлечения данных об индивидуальной выживаемости

  • 13.00 – 13.30 Рыкунов Станислав Дмитриевич, Бойко А. И., Устинин М.Н. Реконструкция электрической структуры тела человека методом спектральной функциональной томографии

    13.30 – 15.00 Перерыв на обед


    Дневное заседание, пленарные доклады <(конференц-зал, ИМПБ РАН)

  • 15.00 – 15.30 Быстров Владимир Сергеевич, Парамонова Е.В., Филиппов С.В., Лихачев И.В., Быстрова А.В., Авакян Л.А., Ковригина С.А., Макарова С.В., Булина Н.В. Особенности структуры и свойств гидроксиапатита с различными катионными замещениями

  • 15.30 – 16.00 Левченко Ирина Николаевна, Панкратов В.С., Владимиров Г.К., Левченко А.А., Володяев И.В. Исследование структуры кардиолипина, ацильной цепи в составе гетерогенного катализатора в присутствии кумарина C314

  • 16.00 – 16.30 Михайлова Анна Алексеевна, Песков К.В., Соколов В.В. Применение Байесовского подхода для оценки параметров механистических моделей количественной фармакологии

  • 16.30 – 17.00 Мишина Анна Евгеньевна, Жуденков К.В., Песков К.В. Эффективность детерминистических моделей в прогнозировании ответа опухоли и приобретенной резистентности у пациентов с НМРЛ

  • 17.00 – 17.30 Тарновский Денис Александрович. Вариант математического моделирования физиологических процессов


    17 октября 2024, четверг

    Утреннее заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)

  • 10.00 – 10.35 Соколов Александр Витальевич, Болондинский В.К., Молчанов А.Г. Оценка области применения математических моделей: Моделирование транспирации и фотосинтеза сосны обыкновенной в различных климатических условиях

  • 10.35 – 11.10 Лелеков Александр Сергеевич. Кинетические и продукционные характеристики культуры микроводорослей в условиях светолимитирования

    11.10 – 12.00 Перерыв

    Дневное заседание, секционные доклады

    Секция А «Вычислительная экология» (конференц-зал, ИМПБ РАН)

  • 12.00 – 12.25 Портнов Алексей Михайлович, Иванова Н.В., Шашков М.П., Шанин В.Н. Различия в результатах детекции деревьев разных видов в пологе разновозрастного полидоминантного широколиственного древостоя с помощью нейросети YOLO

  • 12.25 – 12.50 Минаев Игнат Сергеевич, Нуриева Н.И., Тютюнов Ю.В., Медвинский А.Б. Численная оценка влияния абиотических факторов на характеристики динамики таксономических групп фитопланктона Нарочанских озер

  • 12.50 – 13.15 Минаев Николай Сергеевич, Нуриева Н.И., Тютюнов Ю.В., Тихонов Д., Адамович Б., Медвинский А.Б. Трофические взаимодействия фитопланктон-зоопланктон в экосистеме Нарочанских озер

  • 13.15 – 13.40 Смирнов В.Э., Ханина Лариса Геннадьевна, Иващенко К.В., Бобровский М.В. Оценка влияния крупных лежащих стволов дуба на свойства почв на основе статистических моделей со смешанными эффектами

    13.40 – 14.00 Перерыв

    14.00 – 14.15 Закрытие конференции