17 октября 2022, понедельник
9.00 – 10.00
Регистрация участников (ауд. 320, ИМПБ РАН)
Утреннее заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)
10.00 – 10.20 Открытие мероприятия
10.20 – 10.55 Лахно Виктор Дмитриевич. 50-летие Института математических проблем биологии РАН
10.55 – 11.20 Перерыв
11.20 – 11.50 Устинин Михаил Николаевич. ИМПБ РАН 50 лет. Отдел перспективных информационных технологий
11.50 – 12.20 Лунин Владимир Юрьевич. ИМПБ РАН 50 лет. Лаборатория кристаллографии макромолекул
Текст доклада
12.20 – 12.50 Балабаев Николай Кириллович. ИМПБ РАН 50 лет. Лаборатория молекулярной динамики
Текст доклада
12.50 – 13.20 Назипова Нафиса Наиловна. ИМПБ РАН 50 лет. Лаборатория биоинформатики
Текст доклада
13.20 – 15.00 Перерыв на обед
Дневное заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)
15.00 – 15.30 Махортых Сергей Александрович. ИМПБ РАН 50 лет. Лаборатория обработки данных
Текст доклада
15.30 – 16.00 Быстров Владимир Сергеевич. ИМПБ РАН 50 лет. Группа компьютерного моделирования наноструктур и биосистем
Текст доклада
16.00 – 16.30 Флоринский Игорь Васильевич. ИМПБ РАН 50 лет. Группа геоморфометрического моделирования
Текст доклада
16.30 – 17.00 Ханина Лариса Геннадьевна.
ИМПБ РАН 50 лет. Лаборатория вычислительной экологии
Текст доклада
17.00 – 17.30 Сидорова Алла Эдуардовна, Луценко А.О., Шпигун Д.К. Методы расчёта хиральности вторичных и надвторичных структур белков
Текст доклада
18 октября 2022, вторник
Утреннее заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)
10.00 – 10.35 Фрисман Ефим Яковлевич, Кулаков М.П.
Переход от локальной би- и квадростабильности к пространственно-временной неоднородности
Текст доклада
10.35 – 11.10 Масловская Анна Геннадьевна, Саруханян С.К., Куттлер К.
Реакционно-диффузионный подход в моделировании процессов бактериальной коммуникации
Текст доклада
11.10 – 11.45 Быстров Владимир Сергеевич, Парамонова Е.В., Лихачев И.В., Филиппов С.В., Быстрова А.В., Авакян Л.А., Толчина Д.Б., Макарова С.В.,
Исаев Д.Д., Булина Н.В. Моделирование и компьютерные исследования свойств гидроксиапатита
Текст доклада
11.45 – 12.00 Перерыв
12.00 – 12.35 Оксана Валериановна Галзитская, Мачулин А.В., Дерюшева Е.И., Панфилов А.В., Сурин А.А., Кравченко С.В., Глякина А.В., Гришин С.Ю.
Биоинформатическое исследование семейства бактериальных рибосомных белков S1: особенности структурной организации, амилоидогенные области в S1 доменах, эволюция бактериальных отделов, создание новых антибактериальных пептидов
Текст доклада
12.35 – 13.10 Дедкова А.А., Флоринский Игорь Васильевич.
Геоморфометрическое моделирование нанорельефа по данным атомно-силовой микроскопии
Текст доклада
13.10 – 15.00 Перерыв на обед
Дневное заседание, секционные доклады
Секция А «Популяционное моделирование» (конференц-зал, ИМПБ РАН)
15.00 – 15.20 Лелеков Александр Сергеевич, Ширяев А.В.
Динамика макромолекулярного состава культуры микроводорослей в условиях естественного освещения. Модель
Текст доклада
15.20 – 15.40 Неверова Галина Петровна, Жданова О.Л.
Математическое моделирование сценариев развития планктонного сообщества в процессе эволюции
Текст доклада
15.40 – 16.00 Жданова Оксана Леонидовна, Фрисман Е.Я.
О роли естественного отбора в генетической дивергенции миграционно-связанных популяций: сопоставление результатов эксперимента и математического моделирования
Текст доклада
16.00 – 16.20 Белотелов Николай Вадимович, Бровко А.В.
Модель конкуренции двух популяций с учетом их структурности Текст доклада
16.20 – 16.40 Перерыв
Секция A «Математические модели наноструктур и биомолекул. Математические основы нанобиоэлектроники» (конференц-зал, ИМПБ РАН)
16.40 – 17.00 Коршунова Алевтина Николаевна, Лахно В.Д.
Проявление элементов блоховских осцилляций полярона в процессе его равномерного движения по цепочке
Текст доклада
17.00 – 17.20 Лихачев Илья Вячеславович, Быстров В.С., Балабаев Н.К.
Поиск температуры выпаривания ионов ОН из гидроксиапатита
Текст доклада
17.40 – 18.00 Фиалко Надежда Сергеевна, Ольшевец М.М., Лахно В.Д.
Разрушение полярона при разных способах моделирования термостата
Текст доклада
18.00 – 18.20 Быстров Владимир Сергеевич, Парамонова Е.В., Зеленовский П.С., Фридкин В.М., Tie Lin, Hong Shen, Xiangjian Meng.
Фотоэлектронные свойства дифенилаланиновых пептидных нанотрубок
Текст доклада
18.20 – 18.40 Шигаев Алексей Сергеевич, Лихачёв И.В., Лахно В.Д.
Анализ свойств локусов многопараметрического пространства квантово-классической модели фотоизомеризации родопсина
Текст доклада
Дневное заседание, секционные доклады
Секция Б «Биоинформатика и компьютерная биомедицина» (ауд. 306, ИМПБ РАН)
15.00 – 15.20 Чалей Мария Борисовна, Кутыркин В.А.
Идентификация таксономической принадлежности вирусов с помощью таргетного анализа вирусного генома
Текст доклада
15.20 – 15.40 Белинская Дарья Александровна, Шестакова Н.Н.
Взаимодействие трициклических антидепрессантов с NMDA-рецептором по данным компьютерного моделирования
Текст доклада
15.40 – 16.00 Руднев Владимир Ремович, Никольский К.С., Петровский Д.В., Куликова Людмила Ивановна, Кайшева А.Л., Ефимов А.В.
Исследование стабильности структурных мотивов типа 3β-уголок
Текст доклада
16.00 – 16.20 Яковлева Татьяна Александровна.
Анализ фармакологических данных с использованием методов математического моделирования Текст доклада
16.20 – 16.40 Перерыв
16.40 – 17.00 Богатырев Михаил Юрьевич, Шестака Т.В.
Мультимодальная кластеризация в анализе данных осложнений инфаркта миокарда
Текст доклада
17.00 – 17.20 Кудряшова Наталия Олеговна, Жигач А.Н., Жуденков К.В., Глущенко Н.Н.
Particle diameter, phase composition, surface area and film thickness of copper nanoparticles as predictors of antibacterial activity, toxicity, and wound healing potential
Текст доклада
17.20 – 17.40 Кулеш Виктория Сергеевна.
Обзор подходов к математическому описанию динамики клеток тимуса
Текст доклада
17.40 – 18.00 Фурлетова Евгения Игоревна.
Минимизация автомата Ахо-Корасик. Приложение к вычислению P-значения вхождений образцов
Текст доклада Презентация
Стендовые доклады (коридор 3-го этажа, ИМПБ РАН)
Третьякова Анна Вадимовна, Герасимова Е.О., Крылов П.А., Новочадов В.В.
Филогенетический анализ белка лубрицина и сурфактант-ассоциированных белков B и C
Текст доклада
Герасимова Елена Олеговна, Третьякова А.В., Крылов П.А.
Биоинформационный анализ структурно-функциональных свойств белков поверхностной зоны суставного хряща и белков сурфактанта
Текст доклада
Delgado Curiel Esteban, Deriabina A., Vazquez G. D., Prutskij T., Gonzalez E., Poltev V.
Optical properties of Luteolin: DFT study
Текст доклада
Романов Михаил Сергеевич, Мастеров В.Б.
Анализ эффективности воспроизводства белоплечего орлана на Сахалине с помощью обобщённых линейных смешанных моделей (GLMM)
Текст доклада
Мазуров Михаил Ефимович.
Современные теории сознания, материалистическая макроскопическая
Текст доклада
Дерюшева Евгения Игоревна.
Биоинформатический поиск и формирование панели лигандов сывороточного альбумина, модулирующих его взаимодействие с Аβ-пептидом
Текст доклада
Немашкалова Екатерина Леонидовна.
Фактор роста эндотелия сосудов (VEGF-A165): ассоциация с заболеваниями, моделирование структуры и сравнение с экспериментальными данными
Текст доклада
Полосин Виталий Германович.
Статистический подход к решению обратной задачи электрокардиографии
Текст доклада
Москаленко Андрей Витальевич.
К вопросу о спектральном анализе регуляции основного ритма сердца
Текст доклада
Мачулин Андрей Валериевич.
Биоинформатический анализ нового бактериоцина III класса из L. fermentum 3872
Текст доклада
Sarkar Aditya Kumar.
Contribution of half-site spacing in bZIP-DNA recognition
Текст доклада
Левченко Ирина Николаевна.
Изучение механизма реакций, катализируемых комплексом цитохрома С с кардиолипином
Текст доклада
Pal Rupak.
On the Conformational Preferences of 2-Selenouridine and its Derivatives
Текст доклада
Левченко Ирина Николаевна.
Математическое моделирование квантовых выходов активированной кумарином С-525 хемилюминесценции под действием комплекса цитохрома С с кардиолипином
Текст доклада
Панюков Валерий Васильевич.
Длинные прямые повторы в бактериальных хромосомах
Текст доклада
19 октября, среда
Утреннее заседание, секционные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)
10.00 – 10.25 Портнов Алексей Михайлович, Иванова Н.В., Шашков М.П. Опыт использования нейронной сети DeepForest для детектирования деревьев в широколиственном лесу
Текст доклада
10.25 – 10.50 Ханина Лариса Геннадьевна, Волобуев С.В., Смирнов В.Э., Тутукина М.Н., Шелякин П.В., Бобровский М.В. Разнообразие сообществ грибов и бактерий и динамика физико-химических свойств древесины широколиственных видов деревьев и ели европейской в ходе деструкции после массового ветровала
Текст доклада
10.50 – 11.15 Ханина Лариса Геннадьевна, Бобровский М.В., Смирнов В.Э., Иващенко К.В., Журавлева А.И., Жмайлов И.В. Влияние массового ветровала в широколиственном лесу на свойства песчаных и суглинистых почв
Текст доклада
11.15 – 11.30 Перерыв
11.30 – 11.45 Закрытие конференции
