ОГЛАВЛЕНИЕ
Международная конференция
«Математическая биология и биоинформатика»
Сетевой журнал "Математическая биология и биоинформатика": пути и перспективы достижения международного уровня
    Лахно В.Д., Устинин М.Н., Назипова Н.Н.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e1. doi: 10.17537/icmbb18.112


МАТЕМАТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ НАНОБИОЭЛЕКТРОНИКИ

Эволюция энергии электрона в процессах его захвата мобильным дискретным бризером в молекуле ДНК с закрепленными концами
    Лахно В.Д., Сергеев К.С., Четвериков А.П.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e2. doi: 10.17537/icmbb18.86


Моделирование переноса заряда в гетерогенных олигонуклеотидах при биологически значимой температуре
    Фиалко Н.С., Лахно В.Д.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e3. doi: 10.17537/icmbb18.64


Режимы движения заряда в холстейновской цепочке в постоянном электрическом поле в зависимости от его напряжённости и начального распределения заряда
    Коршунова А.Н., Лахно В.Д.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e4. doi: 10.17537/icmbb18.89


Сравнение квантово-классической модели фотоизомеризации родопсина с квантовомеханическим подходом Хан-Стока
    Шигаев А.С., Фельдман Т.Б., Надточенко В.А., Лахно В.Д.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e5. doi: 10.17537/icmbb18.59


Моделирование переноса заряда в цепочках "донор - однородный мостик - акцептор" при Т = 300 K
    Фиалко Н.С., Лахно В.Д.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e6. doi: 10.17537/icmbb18.58


Нуклеационная длина пузырька денатурации в модели Пейярда-Бишопа-Доксуа и её модификациях
    Гераськин Е.И., Четвериков А.П., Шигаев А.С.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e7. doi: 10.17537/icmbb18.87


Транспорт заряда в однородной молекулярной полинуклеотидной цепочке c начальными смещениями и скоростями нуклеотидных пар
    Коршунова А.Н., Лахно В.Д.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e8. doi: 10.17537/icmbb18.46


Моделирование поляронных и биполяронных состояний в одномерных системах
    Каширина Н.И., Король А.А., Лахно В.Д.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e62. doi: 10.17537/icmbb18.84


Физические сегнетоэлектрические и хиральные свойства различных дипептидных нанотрубок и наноструктур
    Быстров В.С., Бдикин И.К., Твердислов В.А., Жулябина О.А.,Зеленовский П.С., Копыл С.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e9. doi: 10.17537/icmbb18.4


Полярон в постоянном электрическом поле. Возбуждение когерентных колебаний решетки
    Астахова Т.Ю., Виноградов Г.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e10. doi: 10.17537/icmbb18.61


Поиск оптимального шага интегрирования в задаче моделирования динамики заряда в гетерогенных ДНК
    Пятков М.И., Зайцев А.Ю., Ольшевец М.М., Фиалко Н.С.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e11. doi: 10.17537/icmbb18.65


Частичная автоматизация расчетов на гибридных супер-ЭВМ при моделировании переноса заряда в квазиодномерных молекулярных цепочках
    Пятков М.И., Зайцев А.Ю., Ольшевец М.М., Фиалко Н.С.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e12. doi: 10.17537/icmbb18.66


МАТЕМАТИЧЕСКАЯ БИОФИЗИКА

Биофизический смысл интегральных вектор-кардиографических параметров
    Айду Э.А.-И., Трунов В.Г.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e13. doi: 10.17537/icmbb18.49


Лингвистический анализ ритма сердца и 15 типов его диаграмм Пуанкаре
    Черкай А.Д., Власов Ю.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e14. doi: 10.17537/icmbb18.29


Квантование фазового пространства мгновенного сердечного ритма
    Кудинов А.Н., Михеев С.А., Цветков В.П., Цветков И.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e15. doi: 10.17537/icmbb18.21


Торнадо в сердце, его самоорганизация
    Мазуров М.Е., Городков А.Ю., Кикнадзе Г.И.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e16. doi: 10.17537/icmbb18.11


Cтохастический анализ данных лазер-доплерфлоуметрии (ЛДФ) и интервалов cердечных сокращений (R-R)
    Кислухин В.В., Кислухина Е.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e17. doi: 10.17537/icmbb18.9


Влияние активных сокращений на распределение напряжений в стенке резистивного кровеносного сосуда
    Шадрина Н.Х.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e18. doi: 10.17537/icmbb18.19


Математическое моделирование метаболической активности изолированной перфузируемой печени крысы в условиях сниженной оксигенации перфузионной среды
    Шадрин К.В., Пахомова В.Г., Крюкова О.В., Рупенко А.П.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e19. doi: 10.17537/icmbb18.36


Математическое моделирование зависимости времени активации рианодинового рецептора от магния
    Япаров Б.Я, Ивченко В.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e20. doi: 10.17537/icmbb18.69


Влияние 2-тиоуридина на конформацию РНК
    Саркар А.К., Саржинска Д., Лахири А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e21. doi: 10.17537/icmbb18.70


Растительные антибактериальные пептиды и их возможная олигомеризация
    Дутта Ч.С., Глякина A.В., Лахири A., Галзитская O.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e22. doi: 10.17537/icmbb18.73


Модели электрофизиологии сердца и торса человека верифицированные на клинических данных
    Ушенин К.С., Докучаев А., Магомедова С.М., Сопов О.В., Калинин В.В., Соловьева О.Э.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e23. doi: 10.17537/icmbb18.41


Взаимодействие неустойчивостей кровеносного сосуда
    Кузин А.А., Кузин Р.А., Тимербулатов Ш.В., Улемаева С.А., Хакимов А.Г.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e24. doi: 10.17537/icmbb18.16


Описание температурных эффектов в TRP каналах на основе теории Крамерса
    Окенов А.О., Япаров Б.Я., Москвин А.С.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e25. doi: 10.17537/icmbb18.38


Применение пространственно-временной модели активных сред для анализа развития урбоэкосистем
    Сидорова Н.Т., Левашова А.Е., Семина А.Э.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e26. doi: 10.17537/icmbb18.94


Биосфера как иерархия активных сред. Аспекты самоорганизации
    Сидорова А.Э., Твердислов В.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e27. doi: 10.17537/icmbb18.95


Перспективы использования языка SpecML для математического моделирования в задачах кардиофизики
    Тетуев Р.К., Москаленко А.В., Алёшин С.А., Махортых С.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e28. doi: 10.17537/icmbb18.22


Использование языка научных вычислений Julia для моделирования внутриклеточных процессов методом броуновской динамики
    Устинин Д.М.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e29. doi: 10.17537/icmbb18.93


НЕЙРОННЫЕ СЕТИ: ТЕОРИЯ И ПРИМЕНЕНИЕ

Динамика распространения нервного импульса: новые детали старой проблемы
    Морнев О.А., Лысикова Т.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e30. doi: 10.17537/icmbb18.103


Кодирование информации в импульсных избирательных нейронных сетях
    Мазуров М.Е.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e31. doi: 10.17537/icmbb18.26


Обучение избирательных нейронных сетей на основе самоорганизации
    Мазуров М.Е.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e32. doi: 10.17537/icmbb18.28


Моделирование механизма метаболической сверхкомпенсации при активации нейронов
    Крылов А.К.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e33. doi: 10.17537/icmbb18.78


МЕТОДЫ АНАЛИЗА БИОЛОГИЧЕСКИХ И МЕДИЦИНСКИХ ДАННЫХ

Метод спектральной мультиэкспоненциальной аппроксимации для обработки больших массивов экспериментальных данных
    Хрущев С.С., Плюснина Т.Ю.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e34. doi: 10.17537/icmbb18.14


Оценка морфометрических параметров поверхности тела человека по данным биофотограмметрии
    Скрыпицына Т.Н., Спиридонова Е.Е.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e35. doi: 10.17537/icmbb18.39


Метод оптимальных разбиений для оценки влияния степени оксигенации гемоглобина на фактор роста эндотелия сосудов
    Сенько О.В., Кодрян М.С., Кузнецова А.В., Клименко Л.Л.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e36. doi: 10.17537/icmbb18.50


Программный комплекс для анализа данных магнитной энцефалографии методом виртуальных электродов
    Рыкунова Е.Д., Рыкунов С.Д., Бойко А.И., Устинин М.Н.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e37. doi: 10.17537/icmbb18.91


Спектральные особенности энцефалограмм, наблюдаемые при психических расстройствах
    Панкратова Н.М., Рыкунов С.Д., Устинин М.Н.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e38. doi: 10.17537/icmbb18.51


Методы локализации спектральных особенностей энцефалограмм при психических расстройствах
    Устинин М.Н., Рыкунов С.Д., Панкратова Н.М., Бойко А.И., Молчанова Д.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e39. doi: 10.17537/icmbb18.52


Программное обеспечение для обработки данных энцефалографии
    Оплачко Е.С., Рыкунов С.Д., Устинин М.Н.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e40. doi: 10.17537/icmbb18.90


Использование сферических гармоник для анализа источников ЭЭГ при наличии шума
    Лыжко Е.В., Махортых С.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e41. doi: 10.17537/icmbb18.102


Моделирование биологических тканей с использованием технологии 3D реконструкции
    Поляков М.В., Хоперсков А.В., Новочадов В.В., Терпиловский А.А., Тирас Х.П.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e42. doi: 10.17537/icmbb18.79


Методы работы с динамическими молекулярными моделями, построенными в среде открытого 3D редактора Blender
    Филиппов С.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e43. doi: 10.17537/icmbb18.62


Использование параллелизма различных уровней в программе моделирования молекулярной динамики PUMA-CUDA
    Лихачев И.В., Балабаев Н.К.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e44. doi: 10.17537/icmbb18.53


Метод построения динамических молекулярных моделей в среде открытой 3D-платформы Blender на примере β2 -адренорецептора
    Филиппов С.В., Сивожелезов В.С.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e45. doi: 10.17537/icmbb18.23


МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ КОМПОЗИТНЫХ МАТЕРИАЛОВ

Компьютерное моделирование и исследование нанокомпозитов на основе графена и полимерных сегнетоэлектриков
    Быстров В.С., Бдикин И.К., Силибин М.В., Карпинский Д.В., Мэнг К.Я., Лин Т., Тиан Б.Б., Ванг Я.Л., Быстрова А.В., Парамонова Е.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e46. doi: 10.17537/icmbb18.3


Дефекты в гидроксиапатите: структура и свойства, расчеты из первых принципов
    Быстров В.С., Парамонова Е.В., Авакян Л.А., Коутиньо Ж., Быстрова А.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e47. doi: 10.17537/icmbb18.1


Исследование магнитных примесей в гидроксиапатите методами функционала плотности
    Парамонова Е.В., Авакян Л.А., Коутиньо Ж., Быстров В.С.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e48. doi: 10.17537/icmbb18.83


Молекулярно-динамические модели на основе реактивного силового поля нанокомпозитов железо/оксид/углерод, разрабатываемых для магнитной гипертермии
    Авакян Л.А., Манукян А.С., Парамонова Е.В., Богдан А.С., Сухарина Г.С., Шароян Э.Г., Бугаев Л.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e49. doi: 10.17537/icmbb18.42


БИОИНФОРМАТИКА

Создание web-сервера для получения сборки генома de novo на основе объединения результатов, полученных различными программами-сборщиками
    Романенков К.В., Тюльбашева Г.Э., Устинин М.Н., Назипова Н.Н.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e50. doi: 10.17537/icmbb18.104


Поиск паттернов ассоциации между функциональными элементами генома
    Маткаримов О.О., Поливода Д.Э., Попцова М.С.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e51. doi: 10.17537/icmbb18.82


Распознавание скрытой периодичности в последовательностях ДНК на основе стохастических моделей кодирования
    Кутыркин В.А., Чалей М.Б.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e52. doi: 10.17537/icmbb18.8


Особенности кодирующих последовательностей геномов флавивирусов
    Чалей М.Б., Тюлько Ж.С., Кутыркин В.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e53. doi: 10.17537/icmbb18.10


Концептуальный подход к кластеризации в изучении экспрессии генов
    Богатырёв М.Ю., Самодуров К.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e54. doi: 10.17537/icmbb18.81


Исследование метагеномов океанической микробиоты
    Зимин А.А., Назипова Н.Н.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e55. doi: 10.17537/icmbb18.105


Локальное влияние замены аминокислоты на антигенность вируса гриппа
    Форгани М.А., Хачай М.Ю.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e56. doi: 10.17537/icmbb18.107


Распознавание и исследование спиральных пар белковых молекул
    Тихонов Д.А., Куликова Л.И., Руднев В.Р., Ефимов А.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e57. doi: 10.17537/icmbb18.60


База данных структурных мотивов белковых молекул и вычислительные сервисы для их анализа
    Руднев В.Р., Тихонов Д.А., Куликова Л.И., Губин М.Ю., Ефимов А.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e58. doi: 10.17537/icmbb18.88


Использование k-меров для внутривидового типирования бактерий
    Киселев С.С., Озолинь О.Н., Панюков В.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e59. doi: 10.17537/icmbb18.101


Особенности распределения мотивов РНК узнающих белков для протяженных генов 15 хромосомы Homo sapiens
    Федосеева В.Б., Жаринова И.А., Александров А.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e60. doi: 10.17537/icmbb18.48


Проблема доминирования A/T-треков в геноме человека
    Комаров В.М., Самченко А.А., Кондратьев М.С.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e103. doi: 10.17537/icmbb18.114


Предсказание сайтов связывания ионов магния с РНК методами машинного обучения
    Баулин Е.Ф., Тихонова П.О., Ройтберг М.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e61. doi: 10.17537/icmbb18.35


Идентификация антимикробных пептидов в геноме Lycopersicon esculentum
    Ковтун А.С., Истомина Е.А., Слезина М.П., Одинцова Т.И.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e63. doi: 10.17537/icmbb18.13


Распределенная реализация параллельного алгоритма глобального выравнивания протяженных последовательностей
    Панкратов А.Н., Тетуев Р.К., Пятков М.И.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e64. doi: 10.17537/icmbb18.92


Классификация комплексов семейств белков: гомеодомены - ДНК, цинковые пальцы - ДНК. Статистический анализ структур ДНК в интерфейсах комплексов гомеодомен - ДНК
    Грохлина Т.И., Панченко Л.А., Полозов Р.В., Сивожелезов В.С., Иванов В.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e65. doi: 10.17537/icmbb18.98


МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ БИОЛОГИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ И СТРУКТУР БИОМОЛЕКУЛ

Модели клеточной и молекулярной регуляции фотосинтетической цепи водород-выделяющих микроводорослей
    Ризниченко Г.Ю., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Плюснина Т.Ю., Хрущев С.С., Федоров В.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e66. doi: 10.17537/icmbb18.25


Один генотип - два фенотипа: "нейтрально-сопряженная коэволюция" и происхождение персистентных клеток
    Лихошвай В.А., Хлебодарова T.M.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e67. doi: 10.17537/icmbb18.5


О хаотическом потенциале системы локальной трансляции в активированном синапсе
    Хлебодарова T.M., Когай В.В., Лихошвай В.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e68. doi: 10.17537/icmbb18.6


Молекулярно-генетические механизмы формирования мембранного потенциала у Escherichia coli в условиях стационарного роста на нитрите
    Ри Н.А., Хлебодарова T.M., Лихошвай В.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e69. doi: 10.17537/icmbb18.18


Моделирование эволюции усложнения и упрощения метаболизма прокариот в пространственно-гетерогенных средах
    Клименко А.И., Мустафин З.С., Лашин С.А., Матушкин Ю.Г.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e70. doi: 10.17537/icmbb18.15


Математические модели эволюции репликаторных систем: адаптация ландшафта приспособленности
    Братусь А.С., Якушкина Т.С., Дрожжин С.В., Самохин И.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e71. doi: 10.17537/icmbb18.54


Модель укладки мономеров актина в фибрилле
    Глякина А.В., Сурин А.К., Галзитская О.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e72. doi: 10.17537/icmbb18.76


О гибкости мишени при выборе ингибиторов BACE1 для лечения болезни Альцгеймера
    Дас С., Басу С.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e73. doi: 10.17537/icmbb18.72


Конформационная подвижность активного центра мутантной формы 4SER катепсина-L: молекулярная динамика и ab initio вычисления
    Изотова Е.Д., Багаева Т.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e74. doi: 10.17537/icmbb18.45


Водородные связи и локальное упорядочение молекул в воде
    Теплухин А.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e75. doi: 10.17537/icmbb18.34


Определение рода перехода между А- и В-формами молекулы ДНК в рамках крупнозернистой модели
    Ковалева Н.А., Зубова Е.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e76. doi: 10.17537/icmbb18.31


Теоретический анализ механизма спасений микротрубочек за счёт встраиваемых ГТФ островков
    Зайцев А.В., Мустяца В.В., Гудимчук Н.Б.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e77. doi: 10.17537/icmbb18.37


Кинетическая модель динамики микротрубочки с учётом изогнутой конформации тубулина
    Виноградов Д.С., Ульянов Е.В., Гудимчук Н.Б.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e78. doi: 10.17537/icmbb18.27


Компьютерная модель сборки тубулиновых микротрубочек с изогнутыми протофиламентами на конце
    Ульянов Е.В., Виноградов Д.С., Атауллаханов Ф.И., Гудимчук Н.Б.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e79. doi: 10.17537/icmbb18.32


Компьютерное моделирование динамики и структуры концов микротрубочек
    Мустяца В.В., Костарев А.В., Творогова А.В., Атауллаханов Ф.И., Воробьев И.А., Гудимчук Н.Б.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e80. doi: 10.17537/icmbb18.40


Хиральный дуализм, стрела симметрий и молекулярные машины
    Твердислов В.А., Малышко Е.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e81. doi: 10.17537/icmbb18.97


Метод количественной оценки хиральности в иерархиях белковых структур
    Сидорова А.Э., Твердислов В.А., Левашова Н.Т., Котов А.Р., Устинин М.Н.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e82. doi: 10.17537/icmbb18.96


Поиск спейсера для иммобилизации фосфорорганических соединений через стрептавидин-биотиновую систему с помощью компьютерного моделирования
    Белинская Д.А., Гончаров Н.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e83. doi: 10.17537/icmbb18.12


Роль электростатических взаимодействий в связывании психотропных препаратов с NMDA-рецептором по данным компьютерного моделирования
    Шестакова Н.Н., Барыгин О.И., Белинская Д.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e84. doi: 10.17537/icmbb18.57


ПОПУЛЯЦИОННОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ

Возможные сценарии динамики сателлитной популяции, связанной с циклирующими видами
    Фрисман Е.Я., Шлюфман К.В., Неверова Г.П.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e85. doi: 10.17537/icmbb18.68


Моделирование динамики сообщества хищник–жертва с учетом возрастной структуры взаимодействующих видов
    Жданова О.Л., Неверова Г.П., Фрисман Е.Я.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e86. doi: 10.17537/icmbb18.56


Эволюция режимов динамики структурированной популяции, вызванная дифференцированным промыслом
    Неверова Г.П., Фрисман Е.Я.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e87. doi: 10.17537/icmbb18.71


Динамические режимы модели структурированной популяции с учетом избирательного промысла зрелых самцов и самок
    Ревуцкая О.Л., Неверова Г.П., Фрисман Е.Я.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e88. doi: 10.17537/icmbb18.67


Пространственно-временные структуры в системе «активный хищник – пассивная жертва»
    Загребнева А.Д., Говорухин В.Н.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e89. doi: 10.17537/icmbb18.33


Групповая динамика в агентной модели популяции
    Белотелов Н.В., Коноваленко И.А., Назарова В.М.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e90. doi: 10.17537/icmbb18.109


ВЫЧИСЛИТЕЛЬНАЯ ЭКОЛОГИЯ

Базовая форма критерия огибающих и его модификации
    Грабарник П., Миллимяки М.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e91. doi: 10.17537/icmbb18.111


О морфологическом источнике дивергенции хвойных пород деревьев. Модельный анализ
    Галицкий В.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e92. doi: 10.17537/icmbb18.44


Алгоритм построения сетей взаимодействия видов в сообществах на основе результатов мониторинговых экологических исследований
    Букин Ю.С., Михайлов И.С., Черкашин Е.А.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e93. doi: 10.17537/icmbb18.24


Определение удельного потока метана из почвы с помощью обратного моделирования на основе сопряжённых уравнений
    Сабреков А.Ф., Глаголев М.В., Терентьева И.Е.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e94. doi: 10.17537/icmbb18.85


Идентификация скорости потребления метана в почвах методом обратной задачи
    Сабреков А.Ф., Глаголев М.В., Терентьева И.Е., Мочёнов С.Ю.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e95. doi: 10.17537/icmbb18.77


Анализ пространственно-временных данных для оценки влияния травяных пожаров на растительность зарастающих сельскохозяйственных земель
    Ханина Л.Г., Смирнов В.Э., Быховец С.С., Романов М.С., Бобровский М.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e96. doi: 10.17537/icmbb18.108


Моделирование популяции белоплечего орлана: устойчивая возрастная структура или переходная динамика?
    Романов М.С., Мастеров В.Б.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e97. doi: 10.17537/icmbb18.99


Стандарты и веб-инструменты для публикации данных через глобальные порталы по биоразнообразию
    Шашков М.П., Иванова Н.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e98. doi: 10.17537/icmbb18.55


Новая версия модели продукционного процесса 3-PG для основных лесообразующих пород Европейской части РФ
    Шанин В.Н., Грабарник П.Я., Быховец С.С., Чертов О.Г., Шашков М.П., Иванова Н.В., Стаменов М.Н., Фролов П.В.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e99. doi: 10.17537/icmbb18.47


Моделирование динамики популяций охраняемого лишайника Lobaria pulmonaria при разных режимах лесопользования в одновозрастных монодоминантных лесах Костромской области
    Иванова Н.В., Шанин В.Н., Шашков М.П.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e100. doi: 10.17537/icmbb18.20


Анализ данных о начальном росте культур сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) для моделирования циклов C и N при искусственном восстановлении лесов
    Припутина И.В., Фролова Г.Г.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e101. doi: 10.17537/icmbb18.110


Статистический анализ влияния микоризы на сообщества альпийских лугов
    Фариш Н.Р., Лавренов Н.Г.
     Доклады Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика".
     Под ред. В.Д. Лахно. Том 7. Пущино: ИМПБ РАН, 2018. Статья № e102. doi: 10.17537/icmbb18.106