Structure

Laboratory of Macromolecular Crystallography

Full texts of papers, theses, preprints published by the staff of LMC

2003 January 01

2001 2002
1991 1992 1993 1994 1995 1996 1997 1998 1999 2000
1981 1982 1983 1984 1985 1986 1987 1988 1989 1990
1973 1974 1975 1976 1977 1978 1979 1980

2002

  1. Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2002). "Search of the optimal strategy for refinement of atomic models". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 40
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter40/00_contents.html

  2. Afonine, P., Pichon-Pesme, V., Muzet, N., Lecomte, C. & Urzhumtsev, A. (2002). "Modelling of bond electrons by Gaussian scatters at subatomic resolution". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 41
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter41/00_contents.html

  3. Fokine, A. & Urzhumtsev, A.G. (2002). "On the use of low resolution data for translation search in molecular replacement". Acta Cryst., A58, 72-74.

  4. Fokine, A. & Urzhumtsev, A.G. (2002). "Bulk solvent correction for yet unsolved structures". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 40.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter40/00_contents.html

  5. Fokine, A. & Urzhumtsev, A. (2002). "Flat bulk solvent model: getting optimal parameters". Acta Cryst., D58, 1387-1392.

  6. Lunin, V.Y., Afonine P.V. & Urzhumtsev, A.G. (2002). "Likelihood-based refinement. I. Irremovable model errors". Acta Cryst. A58, 270√282.

  7. Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A. & Bockmayr, A. (2002). "Direct phasing by binary integer programming". Acta Cryst. A58, 283√291.

  8. Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A. & Bockmayr, A. (2002). "Direct phasing by Binary integer programming and its use for envelope determination". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 40_12.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter40/00_contents.html

  9. Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (2002). "Retrieval of lost reflections in high resolution Fourier syntheses by a 'soft' solvent flattening". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 41_10.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter41/00_contents.html

  10. Urzhumtsev, A. & Urzhumtseva, L. (2002). "Multiple rotation function". Acta Cryst, D58,2066-2075

  11. Urzhumtseva, L. & Urzhumtsev, A. (2002). "COMPANG: program for comparative analysis of rotation angles". J. Appl.Cryst., 35, 644-647

  12. Urzhumtsev, A. & Urzhumtseva, L. (2002). "SF2CNS: general purpose program to calculate CNS-formatted maps easily". J. Appl. Cryst., 35, 750.

2001

  1. Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Maximum-likelihood refinement of atomic models using least-squares criterion". CCP4 Newsletter on protein crystallography, 39, 52-56.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter39/00_contents.html

  2. Fokine, A. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Improvement of noisy maps by bulk solvent correction". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 39, 71-78
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter39/00_contents.html

  3. Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Ritter, S., Frey, I., Berg, A., Diderichs, K., Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A. & Baumstark M.W. (2001). "Low-resolution data analysis for low-density lipoprotein particle". Acta Cryst., D57, 108-121.
  4. Lunin, V.Y., Podjarny, A.D. & Urzhumtsev, A. (2001). "Low-resolution phasing in macromolecular crystallography". In : Advances in Structure Analysis, CSCA, Prague, Czech Republic, R.Kuzel & J.Hasek, eds., 4-36.

  5. Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A. & Uson, I. (2001). "Ab-initio methods for structure determination". In : Advances in Structure Analysis, CSCA, Prague, Czech Republic, R.Kuzel & J.Hasek, eds., 1-3

  6. Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (2001). "Fast differentiation algorithm and efficient calculation of the exact matrix of second derivatives". Acta Cryst.. A57, 451-460.

  7. Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (2001). "Efficient calculation of the exact matrix of the second derivatives". CCP4 Newsletter on protein crystallography, 39, 60-67.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter39/00_contents.html

  8. Urzhumtsev, A., Podjarny, A. & Lunin, V.Y. (2001). "Ab initio phasing starting from low resolution". Invited article. Euroconference on Phasing, 23-27 June 2001, Martina Franca, Italy, 4.35-4.40

  9. Urzhumtseva, L. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Multiple rotation function". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 39, 79-85
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter39/00_contents.html

2000

  1. Петрова Т.Е. (2000). "Использование принципа максимального правдоподобия при решении фазовой проблемы в кристаллографии макромолекул". Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. Пущино.

  2. Петрова Т.Е. (2000). "Использование принципа максимального правдоподобия при решении фазовой проблемы в кристаллографии макромолекул". Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. ИТЭБ РАН, Пущино.
    Часть 1.
    Часть 2.

  3. Сковорода Т.П., Лунин В.Ю. (2000). "Надежность показателей достоверности, вычисляемых на базе принципа максимума правдоподобия". Кристаллография, 45, No.2, 227-230.

  4. Skovoroda, T.P. & Lunin, V.Yu. (2000). "Reliability of Maximum Likelihood-Based Figures of Merit". Crystallography Reports, 45, No. 2, 195-198.

  5. Brino, L., Urzhumtsev, A.G., Mousli, M., Mitschler, A., Bergdoll, M., Oudet, P. & Moras, D. (2000). "Dimerization of Escherichia coli DNA-gyrase B provides a structural mechanism for activating the ATPase catalytic center". J.Biol.Chem., 275, 9468-9475.

  6. Lunin, V.Y. (2000). "Fixed-scale wavelet-type approximation of periodic density distributions". Acta Cryst. A56, 73-84.

  7. Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Skovoroda, T.P., Urzhumtsev A.G. & Podjarny A.D. (2000). "Low-resolution ab initio phasing: problems and advances". Acta Cryst. D56, 1223-1232.

  8. Lunin, V.Y., Lunina, N.L. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Connectivity properties of high-density regions and ab initio phasing at low resolution". Acta Cryst. A56, 375-382.

  9. Petrova, T.E., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (2000). "Ab initio low-resolution phasing in crystallography of macromolecules by maximization of likelihood". Acta Cryst. D56, 1245-1252.

  10. Shlyapnikov, S.V., Lunin, V.V., Perbandt, M., Polyakov, K.M., Lunin, V.Yu., Levdikov, V.M., Betzel, Ch.& Mikhailov, A.M.. (2000). "Atomic structure of the Serratia marcescens endonuclease at 1.1 A resolution and the enzyme reaction mechanism." Acta Cryst. D56, 567-572.

  11. Urzhumtsev, A.G. (2000). "Modelling of disordered solvent in macromolecular crystals". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 38, 38-49.

    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter38/00_contents.html

  12. Urzhumtsev, A.G., Lunina, N.L., Skovoroda, T.P., Podjarny, A.D. & Lunin, V.Y. (2000). "Density constraints and low-resolution phasing". Acta Cryst. D56, 1233-1244.

  13. Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Tcl/Tk based programs. IV. CALCRYS: crystallographic calculator". J.Appl. Cryst., 33, 992-992

1999

  1. Лунин В.Ю., Благова Е.В., Левдиков В.М., Лунин В.В., Шляпников С.В., Пербандт М., Райшанкар К.С., Бетзель Х., Михайлов А.М. (1999). "Внеклеточная эндонуклеаза Serratia marcescens. I. Пространственная структура белка в кристаллическом состоянии при разрешении 1.7А". Молекулярная биология, 33, 2, 214-222.

  2. Lunin, V.Yu., Blagova, E.V., Levdikov, V.M., Lunin, V.V., Shlyapnikov, S.V., Perbandt, M., Raishankar, K.S., Betzel, H. & Mikhailov, A.M. (1999). "Extracellular Endonuclease of Serratia marcescens. I. Three-Dimensional Structure of Crystalline Protein at 1.7A Resolution". Molecular Biology, 33, 2, 180-187.

  3. Петрова Т.Е., Лунин В.Ю., Лунина Н.Л., Сковорода Т.П. (1999). "Выбор априорного распределения координат атомов для макромолекулярных структур на основании принципа максимума правдоподобия". Биофизика, 44, 1, 22-26.

  4. Petrova, T.E., Lunin, V.Yu., Lunina, N.L. & Skovoroda, T.P. (1999). "Maximum Likelihood Approach to Choosing a Prior Distribution of Atomic Coordinates in Macromolecular Structures". Biophysics, 44, 1, 18-22.

  5. Шляпников С.В., Благова Е.В., Левдиков В.М., Лунин В.Ю., Лунин В.В., Михайлов А.М., Бетзель Х., Райшанкар К.С., Пербандт М. (1999). "Внеклеточная эндонуклеаза Serratia marcescens. II. Аминокислотные остатки активного центра и гипотетический механизм функционирования фермента". Молекулярная биология, 33, 3, 454-461.

  6. Shlyapnikov, S.V., Blagova, E.V., Levdikov, V.M., Lunin, V.Yu., Lunin, V.V., Mikhailov, A.M., Betzel, Ch., Rajashankar, K.S. & Perbandt, M. (1999). "The Extracellular Endonuclease of Serratia marcescens. II. Active Site Amino Acid Residues and a Hypothetical Mechabism of Enzyme Functioning". Molecular Biology, 33, 3, 398-404.

  7. Lunin, V.Y., Lunina, N.L. & Urzhumtsev A.G. (1999). "Seminvariant density decomposition and connectivity analysis and their application to very low resolution macromolecular phasing". Acta Cryst. A55, 916-925.

  8. Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (1999). "Maximal Likelihood Refinement. It works, but why?". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 37, 14-28.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter37/00_contents.html

  9. Petrova, T.E., Lunin V.Y. & Podjarny, A.D. (1999). "A likelihood-based search for the macromolecular position in the crystalline unit cell". Acta Cryst. A55, 739-745.
  10. Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1999). "Tcl/Tk based programs. III. CRITXPL: graphical analysis of the X-PLOR refinement log-files". J.Appl. Cryst., 32, 376-377

  11. Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1999). "Tcl/tk based programs : crystallographic calculator". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 37, 5-6.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter37/00_contents.html

1998

  1. Лунина Н.Л. (1998). "Вычислительные подходы к решению фазовой проблемы кристаллографии биополимеров при низком разрешении". Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.

  2. Лунина Н.Л. (1998). "Вычислительные подходы к решению фазовой проблемы кристаллографии биополимеров при низком разрешении". Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. ИТЭБ РАН, Пущино.

  3. Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny A.D. (1998). "On the Ab initio solution of the Phase Problem for Macromolecules at Very Low Resolution. II. Generalized Likelihood Based Approach to Cluster Discrimination". Acta Cryst. D54, 726-734.

  4. Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. & Lunin V.Y. (1998). "On density modification at very low resolution". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 35, 25-33.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter35/contents.html

  5. Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1998). "Programs Tcl/Tk based crystallographic software : current state and new programs". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 35, 22-24
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter35/contents.html

1997

  1. Lunin, V.Yu., Levdikov, V.M., Shliapnikov, S.V., Blagova, E.V., Lunin V.V., Wilson K.S. & Mikhailov A.M. (1997). "Three-dimensional structure of Serratia marcescens nuclease at 1.7 Ǻ resolution and mechanism of its action". FEBS Letters, 412, 217-222.

  2. Lunin, V.Y. (1997). "The likelihood based choice of priors in statistical approaches to the phase problem". In Direct Methods for Solving Macromolecular Structures, ed. S.Fortier, NATO ASI Series C, Vol.507, 451-454.

  3. Podjarny A.D., Howard E.I., Urzhumtsev A.G. & Grigera J.R. (1997). "A Multicopy Modeling of the Water Distribution in Macromolecular Crystals". Proteins, 28, 303-312.

  4. Podjarny, A.D. &Urzhumtsev, A.G. (1997). "Low resolution phasing". In Methods in Enzymology, Academic Press, San Diego., C.W.Carter, Jr., R.M.Sweet, eds. 276A, 641-658.

  5. Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (1997). "Model based low resolution phasing". In Direct Methods for Solving Macromolecular Structures, ed. S.Fortier, NATO ASI Series C, Vol.507, 421-431.

  6. Urzhumtsev, A.G. (1997). "Local improvement of electron density maps". Acta Cryst., D53, 540-543.

  7. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Podjarny, A.D. (1997). "Low resolution crystallographic images". In Recent Advances in Phasing, Ed. By K.S.W.Wilson, G.Davies, A.W.Ashton & S.Bailey, Proceedings of the CCP4 Study Weekend, University of York, 3-4 January, 1997, 207-214.

  8. Urzhumtsev, A., Tête-Favier, F., Mitschler, A., Barbanton, J., Barth, P., Urzhumtseva, L., Biellmann, J-F., Podjarny, A.D. & Moras, D. (1997). "A 'specificity' pocket inferred from the crystal structures of the complexes of aldose reductase with the pharmaceutically important inhibitors tolrestat and sorbinil". Structure, 5, 5, 601-612.

  9. Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1997). "Tcl/Tk-based programs. II. CONVROT: a program to recalculate different rotation descriptions". J. Appl. Cryst., 30, 402-410.

1996

  1. Вернослова Е.А. (1996). "Разработка и применение программного обеспечения для задач белковой кристаллографии". Автореферат диссертации на соискание ученой степени к.ф.-м.н., ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.

  2. Вернослова Е.А. (1996). "Разработка и применение программного обеспечения для задач белковой кристаллографии". Диссертация на соискание ученой степени к.ф.-м.н., Институт Кристаллографии РАН, Москва.
    Часть 1.
    Часть 2.
    Часть 3.

  3. Lunin, V.Yu. & Lunina, N.L. (1996). "The Map Correlation Coefficient for Optimally Superposed Maps". Acta Cryst. A52, 365-368.

  4. Podjarny, A.D., Rees, B. & Urzhumtsev,A.G. (1996). "Density modification in X-ray crystallography". In Methods in Molecular Biology, "Crystallographic Methods and Protocols ", ed. C.Jones, B.Milloy, M.R.Sanderson, Totowa, New Jersey: Humana Press, 205-226.

  5. Urzhumtsev, A.G. (1996). "Density growing: a method for local improvement of electron density maps". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 32b, 36-39.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter/contents.html

  6. Urzhumtsev A.G. (1996). "Relations between some rotation descriptions for molecular replacement procedure". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 32b, 43-46.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter/contents.html

  7. Urzhumtsev, A. (1996). "Developpement de methodes et logiciels pour la determination de structures macromoleculaires par radiocristallographie. Applications e differents projets". Synthese d'activité scientifique, Strasbourg, 1996.

  8. Urzhumtsev A.G., Skovoroda T.P. &Lunin V.Yu. (1996). "A procedure compatible with X-PLOR for the calculation of electron-density maps weighted using an R-free-likelihood-based approach". J.Appl.Cryst., 29, 741-744.

  9. Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A. & Podjarny, A.D. (1996). "Approaches to Very Low Resolution Phasing of the Ribosome 50S particle from Thermus thermophilus by the Few-Atoms-Models and Molecular-Replacement Methods". Acta Cryst., D52,1092-1097.

  10. Urzhumtseva L.M. & Urzhumtsev A.G. (1996). "Tcl/Tk-based programs. I. CONFOR - user-friendly converter for crystallographic data files". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 32b, 40-42.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletter/contents.html

1995

  1. Ivanov, M.E. & Urzhumtsev, A.G. (1995). "FROG PC - a menu-based environment for atomic model refinement program on a personal computer". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 31, 20-22.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletters.html

  2. Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "On the ab-initio Solution of the Phase Problem for Macromolecules at Very Low Resolution: the Few Atoms Model Method". Acta Cryst., D51, 896-903.

  3. Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1995). "R-free Likelihood-Based Estimates of Errors for Phases Calculated from Atomic Models". Acta Cryst. A51, 880-887.

  4. Navaza, J. & Vernoslova, E. (1995). "On the Fast Translation Functions for Molecular Replacement". Acta Cryst. A51, 445-449.

  5. Tete-Favier, F., Barth, P., Mitchler, A., Podjarny, A.D., Rondeau, J.-M., Urzhumtsev, A., Biellmann, J.-F. & Moras, D. (1995). "Aldose Reductase from Pig Lens". European Journal of Medicinal Chemistry, 30, S, 589-603.

  6. Urzhumtsev A.G. & Podjarny A.D. (1995). "On the Solution of the Molecular Replacement Problem at Very Low Resolution: Application to Large Complexes". Acta Cryst., D51, 888-895.

  7. Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "On the problem of solvent modeling in macromolecular crystals using diffraction data: 1.The low-resolution range". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 31, 12-16.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletters.html

  8. Volkmann, N., Schlünzen, F., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Podjarny, A.D., Roth, M., Pebay-Peyroula , E., Berkovitch-Yellin, Z., Zaytzev-Bashan, A. & Yonath, A. (1995). "On ab-initio phasing of ribosomal particles at very low resolution". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 31, 23-32.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletters.html

1994

  1. Лунин В.Ю. (1994). "Математический аппарат рентгеноструктурного анализа макромолекул". Цикл лекций для магистрантов кафедры прикладной математики Пущинского государственного университета. Рукопись.

  2. Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. (1994). "On the ab-initio solution of the phase problem for macromolecules at very low resolution. The Few Atoms Model method". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 37-44.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletters.html

  3. Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Navaza, J. (1994). "On the solution of the molecular replacement problem at very low resolution: application to a ribosome model crystal". ACA Transactions, 30, 109-120.

  4. Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1994). "Programs for translation searches with two independent models simultaneously". J.Appl.Cryst., 27, 122-124.

  5. Urzhumtsev, A.G., Podjarny & A.D., Navaza, J. (1994). "On the solution of the molecular replacement problem at very low resolution". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 29-36
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletters.html

  6. Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1994). "Published methods in crystallography. Reference database on personal computers". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 45-47.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletters.html

  7. Vernoslova, E.A. & Urzhumtsev, A.G. (1994). "Current development in the program package FROG for atomic model refinement". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 27-28.
    http://www.ccp4.ac.uk/newsletters.html

1993

  1. Лунина Н.Л. (1993). "Учебные компьютерные программы по генетике". "Биология в школе", 5, 49-52.

  2. Lunin, V.Yu. (1993). "Electron-Density Histograms and the Phase Problem". Acta Cryst. D49, 90-99.

  3. Lunin, V.Yu. & Woolfson, M.M. (1993). "Mean Phase Error and the Map Correlation Coefficient". Acta Cryst. D49, 530-533.

  4. Vernoslova, E.A. & Lunin, V.Yu. (1993). "The FROG PC series: programs for electron-density and model investigation for proteins". J. Appl. Cryst., 26, 291-294.

1992

  1. Лунин В.Ю. (1992). "Использование статистических характеристик синтезов Фурье электронной плотности для решения фазовой проблемы в кристаллографии белка". Автореферат диссертации на соискание ученой степени д.ф.-м.н, ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.

  2. Лунин В.Ю. (1992). "Использование статистических характеристик синтезов Фурье электронной плотности для решения фазовой проблемы в кристаллографии белка". Диссертация на соискание ученой степени д.ф.-м.н, ИК РАН, Москва.
    Часть 1.
    Часть 2.
    Часть 3.

  3. Лунина Н.Л.. (1992). "Краткое описание пакета учебных программ "Биология в школе". "Информатика и образование", 5 , 104-105.

  4. Моргунова Е.Ю., Михайлов А.М., Уржумцев А.Г., Вайнштейн Б.К. (1992). "Строение капсида CMtV при разрешении 6А в кристаллическом состоянии". Кристаллография, 37, 2, 396-404.

  5. Lunina, N.L. (1992). "The package of educational programs "BIOLOGY". Software, Pushchino Research Centre, Pushchino, Russia.

  6. Urzhumtsev, A.G. (1992). "On the reliability of atomic models in the PDB: stereochemical point of view". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 31-32.

  7. Vernoslova, E. (1992). "FFT Discrete Three-Dimensional Fourier transform". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 36.

  8. Vernoslova, E. & Lunin, V. (1992). "FAN Scalar Field Analysis". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 35.

  9. Vernoslova, E. & Lunin, V. (1992). "CAN Comparative Analysis of three-dimensional Functions". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 37.

1991

  1. Чиргадзе Ю.Н., Бражников Е.В., Никонов С.В., Фоменкова Н.П., Гарбер М.Б., Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Чиргадзе Ю.Н., Некрасов Ю.В. (1991). "Кристаллическая структура рибосомного фактора G из бактерий Thermus Thermophilus при низком разрешении". Доклады АН СССР, т.320, в.2, 488-491.

  2. Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A., Vernoslova, E.A., Nikonov, S.V., Sergeev, Yu.V., Brazhnikov, E.V., Fomenkova, N.P., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1991). "Crystal structure of calf eye lens gamma-crystallin IIIb at 2.5A resolution: its relation to function". Experimental Eye Research, 53, 295-304.

  3. Lunin, V.Yu. (1991). "Use of the electron-density-syntheses histograms or solving of the phase problem in protein crystallography". Preprint, Pushchino Research Center, Pushchino, Russia.

  4. Lunin, V.Yu. & Skovoroda,T.P. (1991). "Frequency-Restrained Structure Factor Refinement. I. Histogram Simulation". Acta Cryst. A47, 45-52.

  5. Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1991). "Frequency-Restrained Structure Factor Refinement. II. Comparison of Methods". Acta Cryst. A47, 238-243.

  6. Urzhumtsev, A.G. (1991). "How to calculate planarity restraints". Acta Cryst., A47, 723-727.

  7. Urzhumtsev, A.G. (1991). "Low-resolution phases: influence on SIR-syntheses and retrieval with double-step filtration". Acta Cryst., A47, 794-801.

1990

  1. Лунина Н.Л. (1990). "Учебные программы по биологии. Генетика". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ. НЦБИ АН СССР, Пущино.

  2. Лунина Н.Л. (1990). "Компьютеры в обучении: цель и средство". Седьмой семинар "Проблемы информатики и ее применения в управлении, обучении и научных исследованиях". Гелечица'88. Сборник докладов. Университетское издание им. св. " Климента Охридского", София, 167-168.

  3. Лобсанов Ю.Д., Плетнев В.З., Втюрин Н.Н., Лубнин М.Ю., Мокульский М.А., Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Лузянина Т.Б. (1990). "Рентгеноструктурные исследования комплекса лектина из гороха с углеводом при разрешении 2,4А. I. Атомная модель". Биоорганическая химия, 16, 12б 1589-1598.

  4. Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Skovoroda, T.A. (1990). "Direct low-resolution phasing from electron-density histograms in protein crystallography". Acta Cryst., A46, 540-544.

  5. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1990). "New refinement program FROG gives new possibilities to study macromolecular models". Proc.of the First Intern. Meeting on Structure and Chemistry of Ribonucleases, Moscow, USSR, December 1989, 410-415.

1989

  1. Лунина Н.Л.. (1989). "Факультативный курс программирования. Основные понятия". Методические рекомендации, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  2. Лунина Н.Л.. (1989). "Факультативный курс программирования. Бэйсик". Методические рекомендации, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  3. Лунина Н.Л.. (1989). "Факультативный курс программирования. Паскаль". Методические рекомендации, НЦБИ АН СССР. Пущино.

  4. Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Вернослова Е.А. (1989). "FROG - комплекс программ для локального уточнения атомной структуры макромолекул". В сб. "Компьютерные методы белковой инженерии", Программное обеспечение ЭВМ, Институт математики, Институт биоорганической химии АН БССР, 86, 86-97, Минск.

  5. Lunin, V.Yu. (1989). "The Calculation of the Second Moments for the Values of Fourier Syntheses with Random Structure Factors". Acta Cryst. A45, 501-505.

  6. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Luzyanina, T.B. (1989). "Bounding a Molecule in a Noisy Synthesis". Acta Cryst., A45, 34-39.

  7. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1989). "FROG - high-speed restraint-constraint refinement program for macromolecular structure". J. Appl. Cryst., 22, 500-506.

1988

  1. Лунин В.Ю. (1988). "Восстановление недостающих структурных факторов при рентгеноструктурном исследовании макромолекул". Доклады АН СССР, т.299, в.2, 363-366.

  2. Лунина Н.Л. (1988). "Компьютерная поддержка курса биологии". Биология в школе, 5, 57-59.

  3. Лунина Н.Л. (1988). "Пакет учебных программ по английскому языку". Иностранные языки в школе, 3, 36-38.

  4. Лунина Н.Л. (1988). "Учебные программы по биологии. Биосинтез белка". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  5. Лунина Н.Л. (1988). "Курс алгоритмического языка BASIC для ЭВМ YAMAHA". Методические рекомендации, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  6. Лунина Н.Л (1988). "Пакет программ LEARN ENGLISH". Информатика и образование, 5, 72-74.

  7. Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Вернослова Е.А. (1988). "Комплекс программ FROG". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 10, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  8. Lunin, V.Yu. (1988). "Use of Information on Electron Density Distribution in Macromolecules". Acta Cryst, A44, 144-150.

1987

  1. Лунина Н.Л. (1987). "Что могут школьники". Информатика и образование, 6, 72-73.

  2. Лунина Н.Л. (1987). "Курс алгоритмического языка BASIC для ЭВМ YAMAHA". Методические рекомендации, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  3. Лунина Н.Л. (1987). "Пакет учебных программ-тренажеров по английскому языку". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, НЦБИ АН СССР, Пущино.

1986

  1. Чиргадзе Ю.Н., Невская Н.А., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Сергеев Ю.В., Бражников Е.В., Гарбер М.Б., Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Вернослова Е.А. (1986). "Пространственная структура гамма-кристаллина IIIb из хрусталика глаза теленка при разрешении 2,5Ǻ". Доклады АН СССР, 290, 2, 492-495.

  2. Лунин В.Ю. (1986). "Использование информации о распределении значений электронной плотности в белках. I. Восстановление недостающих структурных факторов" Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  3. Лунина Н.Л. (1086). "Обучение школьников программированию". Методические рекомендации, ОНТИ НЦБИ АН СССР, Пущино.

  4. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Luzyanina, T.B. (1986). "Macromolecular position determination with a noisy synthesis at low resolution". Xth European Cryst. Meeting, Wroclaw, Poland, Coll.Abstr., 1A-01, 51-52.

1985

  1. Вазина А.А., Корыстова А.Ф., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Лунин В.Ю., Козлов М.А., Крайзман В.Л. (1985). "Исследование структуры металлосвязывающих центров кальмодулина методом EXAFS-спектроскопии". Молекулярная биология, т.19, в.6, 1643-1647.

  2. Уржумцев А.Г. (1985). "Использование локального усреднения при анализе изображения макромолекул на картах распределения электронной плотности". Препринт, НЦБИ, Пущино.

  3. Уржумцев А.Г. (1985). "Использование смешанной атомной модели для улучшения наборов фаз структурных факторов при рентгеноструктурном исследовании макромолекул". Автореферат диссертации на соискание ученой степени к.ф.-м.н, Институт Кристаллографии АН СССР, Москва.

  4. Уржумцев А.Г. (1985). "Использование смешанной атомной модели для улучшения наборов фаз структурных факторов при рентгеноструктурном исследовании макромолекул". Диссертация на соискание ученой степени к.ф.-м.н, Институт Кристаллографии АН СССР, Москва.
    Часть 1.
    Часть 2.
    Часть 3.

  5. Lunin, V.Yu. (1985). "Use of the Fast Differentiation Algorithm for Phase Refinement in Protein Crystallography". Acta Cryst. A41, 551-556.

  6. Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1985). "Program construction for macromolecule atomic model refinement based on the fast Fourier transform and fast differentiation algorithms". Acta Cryst., A41, 327-333.

  7. Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A. & Fomenkova, N.P. (1985). "Phase Improvement in Protein Crystallography Using a Mixed Electron Density Model". Acta Cryst., A41, 166-171.

1984

  1. Вазина А.А., Корыстова А.Ф., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Лунин В.Ю., Козлов М.А., Крайзман В.Л. & (1984). "Исследование Ca2+-связывающих центров парвальбумина по дальней тонкой структуре рентгеновских спектров поглощения". Молекулярная биология, т. 18, в. 3, 681-684.

  2. Лунин В.Ю. (1984). "Использование алгоритма быстрого дифференцирования в задаче уточнения значений фаз структурных факторов". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  3. Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Вернослова Е.А., Чиргадзе Ю.Н., Фоменкова Н.П., Невская Н.А. (1984). "Использование смешанной модели электронной плотности для улучшения набора фаз в белковой кристаллографии". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  4. Лунина Н.Л. (1984). "Система обработки нуклеотидных последовательностей HEID". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  5. Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1984). "Improvement of Protein Phases by Coarse Model Modification". Acta Cryst., A40, 269-277.

1983

  1. Гаджиев А.М., Матюшин А.М., Вазина А.А., Ясенев М.Я., Шувалов Б.Н., Лунин В.Ю. (1983). "Программное обеспечение метода скоростной рентгеновской дифрaктометрии с высоким временным разрешением". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  2. Кузин А.П., Уржумцев А.Г. (1983). "Уточнение кристаллической структуры актиноксантина при разрешении 1,8А МНК в обратном пространстве". Всесоюзный симпозиум по химии белков и пептидов, Рига, ноябрь 1983, Тезисы докладов, 186.

  3. Лунин В.Ю. (1983). "Рентгеноструктурный анализ белков. Проблемы расшифровки структуры". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  4. Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1983). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем уточнения модельной структуры. I. Численные эксперименты". Кристаллография, 28, в.2, 310-315.

  5. Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1983). "Конструирование программ для уточнения атомной структуры макромолекул на базе алгоритмов быстрого преобразования Фурье и быстрого дифференцирования". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.

1982

  1. Вернослов С.Е., Лунин В.Ю. (1982). "Некоторые алгоритмические вопросы обработки EXAFS-спектров". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  2. Лунин В.Ю. (1982). "Оптимизация расчета структурных факторов в кристаллографии белка". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  3. Лунин В.Ю. (1982). "Использование метода максимального правдоподобия для оценки ошибок при определении фаз в кристаллографии белка". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  4. Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю. (1982). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем уточнения модельной структуры. Улучшение набора фаз для γ-кристаллина IIIb". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.

1981

  1. Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1981). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем уточнения модельной структуры. I. Описание метода". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.

1980

  1. Чиргадзе Ю.Н., Сергеев Ю.В., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Лунин В.Ю. (1980). "Определение структуры g-кристаллина II из глазной линзы теленка с разрешением 5Ǻ". Доклады АН СССР, 250, в.3, 762-765.

  2. Chirgadze, Yu.N., Oreshin, V.D., Sergeev, Yu.V., Nikonov, S.V. & Lunin, V.Yu. (1980). "Structure of gamma-crystallin IIIb from calf lens at 5A resolution". FEBS Letters, 118, 2, 296-298.

1979

  1. Лунин В.Ю. (1979). "Комплекс программ Быстрое преобразование Фурье". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 3, НЦБИ АН СССР, Пущино.

  2. Лунин В.Ю. (1979). "Фазовая программа Тен Эйка". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 4, НЦБИ АН СССР, Пущино.

1978

1977

  1. Лунин В.Ю. (1977). "О финитности пограничного слоя в решениях некоторых классов задач, содержащих малый параметр". Успехи Матем.Наук, XXXII, 1(193), 171-172.

  2. Лунин В.Ю. (1977). "О равномерном приближении главным членом асимптотики решения первой краевой задачи для одного класса квазилинейных эллиптических уравнений". Вестник МГУ, Математика, Механика, 3, 46-57.

1976

  1. Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейных эллиптических уравнений второго порядка". Вестник МГУ, Математика, Механика, 3, 43-51.

  2. Лунин В.Ю. (1976). "Построение главного члена асимптотики решения первой краевой задачи для одного класса квазилинейных эллиптических уравнений". Вестник МГУ, Математика, Механика, 5, 81-87.

  3. Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейного эллиптического уравнения с малым параметром". Автореферат диссертация на соискание ученой степени кадидата ф.-м.н., МГУ, Москва.

  4. Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейного эллиптического уравнения с малым параметром". Диссертация на соискание ученой степени кадидата ф.-м.н., МГУ, Москва.

1975

1974

  1. Лунин В.Ю. (1974). "Оценки решений абстрактных параболических уравнений". Успехи Матем.Наук, т.XXIX, 3(177), 213-214.

1973

  1. Лунин В.Ю. (1973). "Оценки решений абстрактных параболических уравнений с нелинейными возмущениями". Вестник МГУ, Математика, Механика, 6, 56-63.