Лаборатория кристаллографии макромолекул

• ЛКМ Главная страница

Публикации Вернословой Е.А.

По состоянию на 01 января 2003

Внимание! Полные тексты статей, препринтов, диссертаций могут быть найдены здесь.

Статьи в журналах

• Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A. & Podjarny, A.D. (1996). "Approaches to Very Low Resolution Phasing of the Ribosome 50S particle from Thermus thermophilus by the Few-Atoms-Models and Molecular-Replacement Methods". Acta Cryst., D52,1092-1097.
• Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "On the ab-initio Solution of the Phase Problem for Macromolecules at Very Low Resolution: the Few Atoms Model Method". Acta Cryst., D51, 896-903.
• Navaza, J. & Vernoslova, E. (1995). "On the Fast Translation Functions for Molecular Replacement". Acta Cryst. A51, 445-449.
• >Vernoslova, E.A. & Lunin, V.Yu. (1993). "The FROG PC series: programs for electron-density and model investigation for proteins", J.Appl.Cryst., 26, 291-294.
• Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1991). "Frequency-Restrained Structure Factor Refinement. II. Comparison of Methods". Acta Cryst. A47, 238-243.
• Chirgadze, Yu.N.,Nevskaya, N.A., Vernoslova, E.A., Nikonov, S.V., Sergeev, Yu.V., Brazhnikov, E.V., Fomenkova, N.P., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1991). "Crystal structure of calf eye lens gamma-crystalline IIIb at 2.5A resolution: its relation to function". Experimental Eye Research, 53, 295-304.
• Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1989). "FROG - high-speed restraint-constraint refinement program for macromolecular structure". J.Appl.Cryst., 22, 500-506.
• Чиргадзе Ю.Н., Невская Н.А., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Сергеев Ю.В., Бражников Е.В., Гарбер М.Б., Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Вернослова Е.А. (1986). "Пространственная структура гамма-кристаллина IIIb из хрусталика глаза теленка при разрешении 2,5Ǻ". Доклады АН СССР, 290, 2, 492-495.
• Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A. & Fomenkova, N.P. (1985). "Phase Improvement in Protein Crystallography Using a Mixed Electron Density Model". Acta Cryst., A41, 166-171.

Статьи в сборниках

• Volkmann, N., Schlünzen, F., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Podjarny, A.D., Roth, M., Pebay-Peyroula, E., Berkovitch-Yellin, Z., Zaytzev-Bashan, A. & Yonath, A. (1995). "On ab-initio phasing of ribosomal particles at very low resolution". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 31, 23-32.
• Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1994). "On the ab-initio solution of the phase problem for macromolecules at very low resolution. The Few Atoms Model method". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 37-44.
• Vernoslova, E.A. & Urzhumtsev, A.G. (1994). "Current development in the program package FROG for atomic model refinement". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 27-28.
• Vernoslova, E. & Lunin, V. (1992). "FAN Scalar Field Analysis", Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 35.
• Vernoslova, E. (1992). "FFT Discrete Three-Dimensional Fourier transform". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 36.
• Vernoslova, E. & Lunin, V. (1992). "CAN Comparative Analysis of three-dimensional Functions". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 37.
• Urzhumtsev, A.G., Lunin V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1990). "New refinement program FROG gives new possibilities to study macromolecular models". Proc.of the First Intern. Meeting on Structure and Chemistry of Ribonucleases, Moscow, USSR, December 1989, 410-415.
• Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Вернослова Е.А. (1989). "FROG - комплекс программ для локального уточнения атомной структуры макромолекул". В сб. "Компьютерные методы белковой инженерии", Программное обеспечение ЭВМ, Институт математики АН БССР, Институт биоорганической химии, 86, 86-97, Минск.

Препринты, программные выпуски

• Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Вернослова Е.А. (1988). "Комплекс программ FROG". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 10, НЦБИ АН СССР, Пущино.
• Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Вернослова Е.А., Чиргадзе Ю.Н., Фоменкова Н.П., Невская Н.А. (1984). "Использование смешанной модели электронной плотности для улучшения набора фаз в белковой кристаллографии". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.

Диссертации, авторефераты

• Вернослова Е.А. (1996). "Разработка и применение программного обеспечения для задач белковой кристаллографии" Автореферат диссертации на соискание ученой степени к.ф.-м.н., ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.
• Вернослова Е.А. (1996). "Разработка и применение программного обеспечения для задач белковой кристаллографии". Диссертация на соискание ученой степени к.ф.-м.н., Институт Кристаллографии РАН, Москва.

Тезисы конференций

• Podjarny, A.D., Lunina, N., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Petrova, T. & Lunin, V. (1998). "Ab-initio phasing at 30 A of the t50S ribosomal particle with the Few Atoms Model method". ACA Annual Meeting, Arlington, Virginia, July 18-23, 1998, 11.03.08, 74.
• Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Petrova, T., Lunina, N. & Lunin, V. (1998). "Recent advances on the application of the few atom model method to the T50S ribosomal particle". Association Francaise de Cristallographie, AFC98, Orleans, 24-27 fevrier 1998, BCG-A02.
• Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Vernoslova, E.A. (1996). "Very low resolution phasing attempts of the ribosome 50S particle from T. thermophilus by the Few Atoms Model method". XVII Intern.Cryst.Congr., Seattle, USA, August 8-17, 1996, Coll.Abstr., C-67.
• Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu., Vernoslova, E.A., Urzhumtseva, L.M. & Podjarny, A.D. (1995). "La methode FAM pour le phasage ab-initio: Applications". AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, BL15.
• Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Lunina, N.L., Petrova, T.E. & Podjarny, A.D. (1995). "La methode FAM pour le phasage ab-initio: Theorie". AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, P07a.
• Lunin, N.L., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "On the ab-initio solution of the phase problem for macromolecules at very low resolution: the Few Atoms Models method". 4^th European Workshop on Crystallography of Biological Macromolecules, Como (Italy), May 21-25, O19.
• Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu., Vernoslova, E.A., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Navaza, J. & Podjarny, A.D. (1994). "Very low resolution phasing with simple models". 15^th Eur. Cryst. Meeting, Dresden, Germany, 28.8-2.9/1994, Coll.Abstr., R.Oldenbourg Verlag, Munchen, 217.
• Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1994). "A Monte Carlo Approach to low resolution phasing in protein crystallography". ACA Annual Meeting, June 25 - July 1, 1994, INFORUM, Atlanta, Georgia, Atlanta Convention Center, 178.
• Chirgadze, Yu.N., Vernoslova, E.A., Nikonov, S.V., Sergeev, Yu.V., Brazhnikov, E.V., Fomenkova, N.P., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1989). "Refined structure of calf lens g-crystallin IIIb at 2.5A resolution". XIIth European Cryst. Meeting, Moscow, USSR, August 1989, Coll.Abstr., 2, 362.
• Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1989). "FROG - new refinement program". XIIth European Cryst. Meeting, Moscow, USSR, August 1989, Coll.Abstr., 3, 193.
• Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A., Urzhumtsev, A.G. & Vernoslova, E.A. (1989). "Structure refinement of “dry” form of calf lens γ-crystalline IIIb at 1.9A resolution". XIIth European Cryst. Meeting, Moscow, USSR, August 1989, Coll.Abstr., 2, 363.
• Murzin A.G. & Vernoslova E.A. (1988). "Computer modelling of protein hybrids: phage T4 lysozime with a Ca²⁺ - binding module (FE-hand)". V conference of young scientist of socialist countries on Bioorganic Chemistry, Abstracts, Pushchino, (USSR), 83-84.