 |
|
|
Лаборатория молекулярной динамики
Основные направления исследований:
Развитие методов компьютерного моделирования биомолекулярных систем
- В Лаборатории ведется разработка новых подходов к решению проблем моделирования больших биомолекулярных систем с учетом влияния окружающей среды (растворителя). Среди них особое место занимает метод "столкновительной динамики", позволяющий не только эффективно учитывать влияние растворителя на
структуру и динамику исследуемой молекулы, но и более корректно (по сравнению с другими методиками молекулярной динамики) поддерживать термодинамическое равновесие в изучаемой системе;
- Разработана и продолжает совершенствоваться система атом-атомных потенциальных функций, моделирующая взаимодействия растворенных биомакромолекул с водой и ионами;
- Составлено и отлажено большое количество компьютерных программ, успешно используемых как сотрудниками
Лаборатории, так и учеными из других институтов России и за ее пределами;
- Разработаны (и уже применяются) первые программы для проведения расчетов на многопроцессорных компьютерах (в том числе и суперкомпьютерах) и вычислительных комплексах типа МВС-1000 с использованием распараллеленных алгоритмов на основе MPI;
- Для визуального анализа строения изучаемых систем широко используются современные методы программирования
молекулярной графики (OpenGL).
|
|
|
|
|
|
|
