Лаборатория кристаллографии макромолекул
Публикации Луниной Н.Л.
По состоянию на 01 января 2003
Внимание! Полные тексты статей, препринтов, диссертаций могут быть найдены здесь.
Работы по кристаллографии
Статьи в журналах
- Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Ritter, S., Frey, I., Berg, A., Diderichs, K., Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A. & Baumstark M.W. (2001).
"Low-resolution data analysis for low-density lipoprotein particle".
Acta Cryst., D57, 108-121.
- Lunin V.Y., Lunina N.L. & Urzhumtsev A.G. (2000).
"Connectivity properties of high-density regions and ab initio phasing at low resolution".
Acta Cryst., A56, 375-382.
- Lunin V.Y., Lunina N.L., Petrova T.E., Skovoroda T.P., Urzhumtsev A.G. & Podjarny A.D. (2000).
"Low-resolution ab initio phasing: problems and advances".
Acta Cryst., D56, 1223-1232.
- Urzhumtsev A.G., Lunina N.L., Skovoroda T.P., Podjarny A.D. & Lunin V.Y. (2000).
"Density constraints and low-resolution phasing".
Acta Cryst., D56, 1233-1244.
- Lunin V.Y., Lunina N.L. & Urzhumtsev A.G. (1999).
"Seminvariant density decomposition and connectivity analysis and their application to very low resolution macromolecular phasing".
Acta Cryst., A55, 916-925.
- Petrova, T.E., Lunin V.Y. & Podjarny, A.D. (1999).
"A likelihood-based search for the macromolecular position in the crystalline unit cell".
Acta Cryst., A55, 739-745.
- Петрова Т.Е., Лунин В.Ю., Лунина Н.Л., Сковорода Т.П. (1999).
"Выбор априорного распределения координат атомов для макромолекулярных структур на основании принципа максимума правдоподобия".
Биофизика, 44, 1, 22-26.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev A.G. & Podjarny A.D. (1998).
"On the Ab initio solution of the Phase Problem for Macromolecules at Very Low Resolution. II. Generalized Likelihood Based Approach to Cluster Discrimination".
Acta Cryst. D54, 726-734.
- Lunin, V.Yu. & Lunina, N.L. (1996).
"The Map Correlation Coefficient for Optimally Superposed Maps".
Acta Cryst. A52, 365-368.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. (1995).
"On the ab-initio Solution of the Phase Problem for Macromolecules at Very Low Resolution: the Few Atoms Model Method".
Acta Cryst., D51, 896-903.
Статьи в сборниках
- N.L. Lunina , V.Y. Lunin & A.D. Podjarny. (2002).
"Retrieval of lost reflections in high resolution Fourier syntheses by a ‘soft’ solvent flattening".
CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 41_10.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. (1994).
"On the ab-initio solution of the phase problem for macromolecules at very low resolution. The Few Atoms Model method".
Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 37-44.
-
Диссертации, авторефераты
- Лунина Н.Л. (1998).
"Вычислительные подходы к решению фазовой проблемы кристаллографии биополимеров при низком разрешении".
Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.
- Лунина Н.Л. (1998).
"Вычислительные подходы к решению фазовой проблемы кристаллографии биополимеров при низком разрешении".
Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук, ИТЭБ РАН, Пущино.
Тезисы конференций
- Fokine, A., Lunina, N., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2002).
"Bulk solvent and its role in macromolecular phasing".
Acta Cryst., A58, S, C267 [Collected Abstracts, XIXth IUCr Congress & General Assembly, 6-15 August 2002, Geneva, Switzerland, 267]
- Lunina, N.L. (2002).
"The use of connectivity properties of electron density distributions in determination of structures of biological macromolecules".
V International Congress on Mathematical Modelling, September30-October 6, 2002, Dubna, Moscow Region, Book of Abstracts, Volume II, Joint Institute of Nuclear Research, Laboratory of Information Technologies, Council on mathematical modelling of RAS, Dubna 2002, 210.
- Urzhumtsev, A., Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Podjarny, A. & Baumstark, M. (2002).
"LDL particle : Direct structure determination ".
Collected Abstracts, ACA Meeting, 25-30 May 2002, San Antonio, USA, 33.
- Urzhumtsev, A., Lunina, N., Chabriere, E. & Lunin, V.Y. (2002).
"Direct phasing in crystallography : connectivity of electron density maps".
Z. Krist., Suppl. 19, 16. [Collected Abstracts, DGK Meeting, 4-7 March 2002, Kiel, Germany].
- Urzhumtsev, A., Lunina, N.L. & Lunin, V.Y. (2002).
"The connectivity-based choice in macromolecular low resolution ab-initio phasing".
Acta Cryst., A58, S, C43 [Collected Abstracts, XIXth IUCr Congress & General Assembly, 6-15 August 2002, Geneve, Switzerland, 43]
- Chabriere, E., Lunina, N., Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (2001).
"Phasage ab initio par critères de connectivité: de la basse résolution aux structures secondaires".
AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de Cristallographie, Orsay, 3-6 juillet 2001, 99.
- Chabriere, E., Lunina, N., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2001).
"From low resolution to secondary structure elements".
ECM-20 Abstracts, XXth European Cryst.Meeting, 25-31 August 2001, Krakow, Poland, 70.
- Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2000).
"Use of map connectivity properties in macromolecular ab-initio phasing".
Acta Cryst. A56, S, S62.
- Ritter, S., Lunina, N. L., Lunin, V. Y., Urzhumtsev, A. G., Podjarny, A.D., Frey, I., Diederichs, K. & Baumstark, M.W. (2000).
"Crystallization and structure determination of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution, using ab initio phases".
Acta Cryst. A56, S, S299.
- Urzhumtsev, A., Lunin, V.Y. & Lunina, N. (2000).
"Density constraints and direct phasing".
Acta Cryst. A56, S, S108
- Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2000).
"Use of map connectivity properties in macromolecular ab-initio phasing".
19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st August 2000 Nancy, France, 62.
- Urzhumtsev, A., Lunin, V.Y. & Lunina, N. (2000).
"Density constraints and direct phasing".
19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st August 2000 Nancy, France, 108.
- Ritter, S., Lunina, N.L., Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D., Frey, I., Diederichs, K. & Baumstark, M.W. (2000).
"Crystallizacion and structure determination of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution, using ab initio phases".
19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st August 2000 Nancy, France, 299.
- Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Podjarny, A.D., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Baumstark, M.W. & Urzhumtsev, A.G. (2000).
"Structure of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution: ab initio phasing methods for structure determination".
ECM19 Satellite Meeting “Frontiers in macromolecular crystallography”, Bishenberg, August, 31-September, 3, France, 31.
- Lunina, N., Lunin, V.Y., Podjarny, A., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Baumstark, M. & Urzhumtsev, A. (2000).
"Structure of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution: structure determination and analysis".
ECM19 Satellite Meeting “Frontiers in macromolecular crystallography”, Bishenberg, August, 31-September, 3, France, 32.
- Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (1999).
"The connectivity-based choice in macromolecular low resolution ab-initio phasing".
XVIII Congress and General Assembly of ICU, Glasgow, Scotland, UK, August 4-13, 1999. Collected Abstracts, 123.
- Urzhumtsev, A.G., Lunina, N. & Lunin, V. (1999)
"Proprietes Topologiques et Phasage Direct".
GTBio-99, 12-15 Oct. 1999,Hourtin (Bordeaux, France), CO31.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1998).
"Very low resolution ab-initio phasing. Problems and advances".
Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (A), 131-132.
- Lunina, N.L. (1998).
"Software for very low resolution ab-initio phasing".
Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (B), 480-481.
- Podjarny, A.D., Lunina, N., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Petrova, T. & Lunin, V. (1998).
"Ab-initio phasing at 30 A of the t50S ribosomal particle with the Few Atoms Model method".
ACA Annual Meeting, Arlington, Virginia, July 18-23, 1998, 11.03.08, 74.
- Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Petrova, T., Lunina, N. & Lunin, V. (1998).
"Recent advances on the application of the few atom model method to the T50S ribosomal particle".
Association Francaise de Cristallographie, AFC98, Orleans, 24-27 fevrier 1998, BCG-A02.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Y. & Lunina, N.L. (1998).
"Seminvariant density decomposition and connectivity analysis in the low resolution macromolecular phasing".
Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (A), 482-483.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1997).
"A generalized likelihood and the phase cluster choice problem".
In Direct methods for solving macromolecular structures, Lecture Notes, Erice, Italy, May 22 - June 02 1997, 485.
- Лунина Н.Л., Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1997).
"Выращивание плотности" - новый метод локального улучшения синтезов Фурье".
Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 222.
- Lunina, N.L. & Urzhumtsev, A. (1997).
"Density growing: a new approach to the local improvement of electron density maps".
XVIIth European Cryst.Meeting, 24-28 August 1997, Lisbon, Portugal, 92.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu., Vernoslova, E.A., Urzhumtseva, L.M. & Podjarny, A.D. (1995).
"La methode FAM pour le phasage ab-initio: Applications".
AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, BL15.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995).
"On the ab-initio solution of the phase problem for macromolecules at very low resolution: the Few Atoms Models method".
4th European Workshop on Crystallography of Biological Macromolecules, Como (Italy), May 21-25, O19.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu., Vernoslova, E.A., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Navaza, J. & Podjarny, A.D. (1994).
"Very low resolution phasing with simple models".
15th Eur. Cryst. Meeting, Dresden, Germany, 28.8-2.9/1994, Coll.Abstr., R.Oldenbourg Verlag, Munchen, 217.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1994).
"A Monte Carlo Approach to low resolution phasing in protein crystallography".
ACA Annual Meeting, June 25 - July 1, 1994, INFORUM, Atlanta, Georgia, Atlanta Convention Center, 178.
Работы Н.Л.Луниной по информатике
- Лунина Н.Л. (1993).
"Учебные компьютерные программы по генетике"
Биология в школе, 5, 49-52.
- Лунина Н.Л.. (1992).
"Краткое описание пакета учебных программ "Биология в школе".
Информатика и образование, 5, 104-105.
- Lunina, N.L. (1992).
"The package of educational programs "BIOLOGY".
Software, Pushchino Research Centre, Pushchino, Russia.
- Лунина Н.Л. (1991).
"Пакет учебных программ "Биология в школе".
Тезисы докладов Международной конференции "Применение новых компьютерных технологий в образовании". Москва, "Наука", 35-36.
- Лунина Н.Л. (1990).
"Учебные программы по биологии. Генетика".
Материалы по математическому обеспечению ЭВМ. НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунина Н.Л. (1990).
"Компьютеры в обучении: цель и средство".
Седьмой семинар "Проблемы информатики и ее применения в управлении, обучении и научных исследованиях". Гелечица'88. Сборник докладов. Университетское издание им. св. "Климента Охридского", София, 167-168.
- Лунина Н.Л.. (1989).
"Факультативный курс программирования. Основные понятия".
Методические рекомендации, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунина Н.Л.. (1989).
"Факультативный курс программирования. Бэйсик".
Методические рекомендации, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунина Н.Л.. (1989).
"Факультативный курс программирования. Паскаль".
Методические рекомендации, НЦБИ АН СССР. Пущино.
- Лунина Н.Л. (1988).
"Компьютерная поддержка курса биологии".
Биология в школе, 5, 57-59.
- Лунина Н.Л. (1988).
"Пакет учебных программ по английскому языку".
Иностранные языки в школе, 3, 36-38.
- Лунина Н.Л. (1988).
"Учебные программы по биологии. Биосинтез белка".
Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунина Н.Л. (1988).
"Курс алгоритмического языка BASIC для ЭВМ "YAMAHA".
Методические рекомендации, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунина Н.Л (1988).
"Пакет программ "LEARN ENGLISH".
Информатика и образование, 5, 72-74.
- Лунина Н.Л. (1988).
"Компьютеры в обучении: цель и средство".
Седьмой семинар "Проблемы информатики и ее применения в управлении, обучении и научных исследованиях" Гелечица'88. Аннотации докладов. София.
- Лунина Н.Л. (1988).
"Компьютерная поддержка школьного курса общей биологии".
Материалы IV всесоюзного семинара "Разработка и применение программных средств ПЭВМ в учебном процессе". Тезисы докладов. Москва.
- Лунина Н.Л. (1987).
"Что могут школьники".
Информатика и образование, 6, 72-73.
- Лунина Н.Л. (1987).
"Курс алгоритмического языка BASIC для ЭВМ "YAMAHA".
Методические рекомендации, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунина Н.Л. (1987).
"Пакет учебных программ-тренажеров по английскому языку".
Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунина Н.Л. (1986).
"Обучение школьников программированию".
Методические рекомендации, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунина Н.Л. (1984).
"Система обработки нуклеотидных последовательностей HEID".
Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, НЦБИ АН СССР, Пущино.
|