Структура
Главная
События
Администрация
Структура
Достижения
Сотрудники
Публикации
Популярно о науке
Конференция ICMBB
История
Файловый архив
Ссылки
Контакты

Лаборатория кристаллографии макромолекул

Публикации Лунина В.Ю.

По состоянию на 01 января 2003

Внимание! Полные тексты статей, препринтов, диссертаций могут быть найдены здесь.

  • Работы по кристаллографии
  • Работы по математике

    Работы по кристаллографии

    Статьи в журналах

    • Lunin, V.Y., Afonine P.V. & Urzhumtsev, A.G. "Likelihood-based refinement. I. Irremovable model errors". (2002). Acta Cryst. A58, 270–282.
    • Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A. & BockmayrA. "Direct phasing by binary integer programming". (2002). Acta Cryst. A58, 283–291.
    • Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Ritter, S., Frey, I., Berg, A., Diderichs, K., Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A. & Baumstark M.W. "Low-resolution data analysis for low-density lipoprotein particle". (2001). Acta Cryst., D57, 108-121.
    • Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. "Fast differentiation algorithm and efficient calculation of the exact matrix of second derivatives". (2001). Acta Cryst. A57, 451-460.
    • Lunin V.Y. (2000). "Fixed-scale wavelet-type approximation of periodic density distributions". Acta Cryst. A56, 73-84.
    • Lunin V.Y., Lunina N.L. & Urzhumtsev A.G. (2000) "Connectivity properties of high-density regions and ab initio phasing at low resolution". Acta Cryst. A56, 375-382.
    • Lunin V.Y., Lunina N.L., Petrova T.E., Skovoroda T.P., Urzhumtsev A.G. & Podjarny A.D. (2000). "Low-resolution ab initio phasing: problems and advances". Acta Cryst. D56, 1223-1232.
    • Urzhumtsev A.G., Lunina N.L., Skovoroda T.P., Podjarny A.D. & Lunin V.Y. (2000). "Density constraints and low-resolution phasing". Acta Cryst. D56, 1233-1244.
    • Petrova T.E., Lunin V.Y. & Podjarny A.D. (2000). "Ab initio low-resolution phasing in crystallography of macromolecules by maximization of likelihood". Acta Cryst. D56, 1245-1252.
    • Shlyapnikov S.V., Lunin V.V., Perbandt M., Polyakov K.M., Lunin V.Yu., Levdikov V.M., Betzel Ch. & Mikhailov A.M.. (2000). "Atomic structure of the Serratia marcescens endonuclease at 1.1 A resolution and the enzyme reaction mechanism". Acta Cryst. D56, 567-572.
    • Сковорода Т.П., Лунин В.Ю. (2000). "Надежность показателей достоверности, вычисляемых на базе принципа максимума правдоподобия". Кристаллография, 45, №2, 227-230.
    • Lunin V.Y., Lunina N.L., Urzhumtsev A.G. "Seminvariant density decomposition and connectivity analysis and their application to very low resolution macromolecular phasing", Acta Cryst. (1999). A55, 916-925.
    • Petrova, T.E., Lunin V.Y. & Podjarny, A.D. (1999). "A likelihood-based search for the macromolecular position in the crystalline unit cell", Acta Cryst. A55, 739-745.
    • Лунин В.Ю., Благова Е.В., Левдиков В.М., Лунин В.В., Шляпников С.В., Пербандт М., Райшанкар К.С., Бетзель Х., Михайлов А.М. (1999). "Внеклеточная эндонуклеаза Serratia marcescens. Пространственная структура белка в кристаллическом состоянии при разрешении 1.7А". Молекулярная биология, 33, 2,214-222.
    • Шляпников С.В., Благова Е.В., Левдиков В.М., Лунин В.Ю., Лунин В.В., Михайлов А.М., Бетзель Х., Райшанкар К.С., Пербандт М. (1999). "Внеклеточная эндонуклеаза Serratia marcescens. II. Аминокислотные остатки активного центра и гипотетический механизм функционирования фермента". Молекулярная биология, 33, 454-461.
    • Петрова Т.Е., Лунин В.Ю., Лунина Н.Л., Сковорода Т.П. (1999). "Выбор априорного распределения координат атомов для макромолекулярных структур на основании принципа максимума правдоподобия". Биофизика, 44, 1, 22-26.
    • Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny A.D. (1998). "On the Ab initio solution of the Phase Problem for Macromolecules at Very Low Resolution. II. Generalized Likelihood Based Approach to Cluster Discrimination". Acta Cryst. D54, 726-734.
    • Lunin, V.Yu., Levdikov, V.M., Shliapnikov, S.V., Blagova, E.V., Lunin V.V., Wilson, K.S. & Mikhailov A.M. (1997). "Three-dimensional structure of Serratia marcescens nuclease at 1.7 Ǻ resolution and mechanism of its action". FEBS Letters, 412, 217-222.
    • Lunin, V.Yu. & Lunina, N.L. (1996). "The Map Correlation Coefficient for Optimally Superposed Maps". Acta Cryst. A52, 365-368.
    • Urzhumtsev A.G., Skovoroda T.P. & Lunin V.Yu. (1996). "A procedure compatible with X-PLOR for the calculation of electron-density maps weighted using an R-free-likelihood-based approach". J.Appl.Cryst., 29, 741-744.
    • Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1995). "R-free Likelihood-Based Estimates of Errors for Phases Calculated from Atomic Models". Acta Cryst. A51, 880-887.
    • Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. (1995). "On the ab-initio Solution of the Phase Problem for Macromolecules at Very Low Resolution: the Few Atoms Model Method". Acta Cryst., D51, 896-903.
    • Lunin, V.Yu. (1993). "Electron-Density Histograms and the Phase Problem". Acta Cryst. D49, 90-99.
    • Vernoslova E.A. & Lunin V.Yu. (1993) "The FROG PC series: programs for electron-density and model investigation for proteins". J.Appl.Cryst., 26, 291-294.
    • Lunin, V.Yu. & Woolfson, M.M. (1993). "Mean Phase Error and the Map Correlation Coefficient". Acta Cryst. D49, 530-533.
    • Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1991). "Frequency-Restrained Structure Factor Refinement. I. Histogram Simulation". Acta Cryst. A47, 45-52.
    • Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1991). "Frequency-Restrained Structure Factor Refinement. II. Comparison of Methods". Acta Cryst. A47, 238-243.
    • Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A., Vernoslova, E.A., Nikonov, S.V., Sergeev, Yu.V., Brazhnikov, E.V., Fomenkova, N.P., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1991). " Crystal structure of calf eye lens gamma-crystalline IIIb at 2.5A resolution: its relation to function". Experimental Eye Research, 53, 295-304.
    • Чиргадзе Ю.Н., Бражников Е.В., Никонов С.В., Фоменкова Н.П., Гарбер М.Б., Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Чиргадзе Ю.Н., Некрасов Ю.В. (1991). "Кристаллическая структура рибосомного фактора из бактерий Thermus Thermophilus при низком разрешении". Доклады АН СССР, 320, в.2, 488-491.
    • Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Skovoroda, T.A. (1990). "Direct low-resolution phasing from electron-density histograms in protein crystallography". Acta Cryst., A46, 540-544.
    • Лобсанов Ю.Д., Плетнев В.З., Втюрин Н.Н., Лубнин М.Ю., Мокульский М.А., Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Лузянина Т.Б. (1990). "Рентгеноструктурные исследования комплекса лектина из гороха с углеводом при разрешении 2,4А. I. Атомная модель". Биоорганическая химия, 16, 12б 1589-1598.
    • Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Luzyanina, T.B. (1989). "Bounding a Molecule in a Noisy Synthesis". Acta Cryst., A45, 34-39.
    • Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1989). "FROG - high-speed restraint-constraint refinement program for macromolecular structure". J.Appl.Cryst., 22, 500-506.
    • Lunin, V.Yu. (1989). "The Calculation of the Second Moments for the Values of Fourier Syntheses with Random Structure Factors". Acta Cryst. A45, 501-505.
    • Lunin, V.Yu. (1988). "Use of Information on Electron Density Distribution in Macromolecules". Acta Cryst. A44, 144-150.
    • Лунин В.Ю. (1988). "Восстановление недостающих структурных факторов при рентгеноструктурном исследовании макромолекул". Доклады АН СССР, 299, в.2, 363-366.
    • Чиргадзе Ю.Н., Невская Н.А., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Сергеев Ю.В., Бражников Е.В., Гарбер М.Б., Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Вернослова Е.А. (1986). "Пространственная структура гамма-кристаллина IIIb из хрусталика глаза теленка при разрешении 2,5Ǻ". Доклады АН СССР, 290, 2, 492-495.
    • Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A. & Fomenkova, N.P. (1985). "Phase Improvement in Protein Crystallography Using a Mixed Electron Density Model". Acta Cryst., A41, 166-171.
    • Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1985). "Program construction for macromolecule atomic model refinement based on the fast Fourier transform and fast differentiation algorithms". Acta Cryst., A41, 327-333.
    • Lunin, V.Yu. (1985). "Use of the Fast Differentiation Algorithm for Phase Refinement in Protein Crystallography". Acta Cryst. A41, 551-556.
    • Вазина А.А., Корыстова А.Ф., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Лунин В.Ю., Козлов М.А., Крайзман В.Л. (1985). "Исследование структуры металлсвязывающих центров альмодулина методом EXAFS-спектроскопии" Молекулярная биология, 19, в.6, 1643-1647.
    • Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1984). "Improvement of Protein Phases by Coarse Model Modification". Acta Cryst., A40, 269-277.
    • Вазина А.А., Корыстова А.Ф., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Лунин В.Ю., Козлов М.А., Крайзман В.Л. (1984). "Исследование Ca2+-связывающих центров парвальбумина по дальней тонкой структуре рентгеновских спектров поглощения". Молекулярная биология, 18, в. 3, 681-684.
    • Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г.(1983). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем уточнения модельной структуры. I. Численные эксперименты". Кристаллография, 28, в.2, 310-315.
    • Чиргадзе Ю.Н., Сергеев Ю.В., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Лунин В.Ю. (1980). "Определение структуры g-кристаллина из глазной линзы теленка с разрешением 5Ǻ". Доклады АН СССР, 250, в.3, 762-765.
    • Chirgadze, Yu.N., Oreshin, V.D., Sergeev, Yu.V., Nikonov, S.V. & Lunin, V.Yu. (1980). "Structure of gamma-crystalline IIIb from calf lens at 5A resolution". FEBS Letters, 118, 2, 296-298.

    Статьи сборниках

    • Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A. & Bockmayr, A. (2002). "Direct phasing by Binary integer programming and its use for envelope determination". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 40_12.
    • Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2002). "Search of the optimal strategy for refinement of atomic models". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 40_14.
    • Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (2002). "Retrieval of lost reflections in high resolution Fourier syntheses by a ‘soft’ solvent flattening". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 41_10.
    • Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Maximum-likelihood refinement of atomic models using least-squares criterion". CCP4 Newsletter on protein crystallography, 39, 52-56.
    • Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (2001). "Efficient calculation of the exact matrix of the second derivatives". CCP4 Newsletter on protein crystallography, 39, 60-67.
    • Lunin, V.Y., Podjarny, A.D. & Urzhumtsev, A. (2001). "Low-resolution phasing in macromolecular crystallography". In : Advances in Structure Analysis, CSCA, Prague, Czech Republic, R.Kuzel & J.Hasek, eds., 4-36.
    • Urzhumtsev, A., Podjarny, A. & Lunin, V.Y. (2001). "Ab initio phasing starting from low resolution". Euroconference on Phasing, 23-27 June 2001, Martina Franca, Italy, 4.35-4.40.
    • Lunin, V.Y. & Urzhumtsev A.G. (1999). "Maximal Likelihood Refinement. It works, but why?". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 37, 14-28.
    • Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. & Lunin, V.Y. (1998). "On density modification at very low resolution". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 35, 25-33.
    • Lunin, V.Y. (1997). "The likelihood based choice of priors in statistical approaches to the phase problem". In Direct Methods for Solving Macromolecular Structures, ed. S.Fortier, NATO ASI Series C, Vol.507, 451-454.
    • Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (1997). "Model based low resolution phasing". Direct Methods for Solving Macromolecular Structures, ed. S.Fortier, NATO ASI Series C, Vol.507, 421-431.
    • Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Podjarny, A.D. (1997). "Low resolution crystallographic images". In Recent Advances in Phasing, Ed. By K.S.W.Wilson, G.Davies, A.W.Ashton & S.Bailey, Proceedings of the CCP4 Study Weekend, University of York, 3-4 January, 1997, 207-214.
    • Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1994). "On the ab-initio solution of the phase problem for macromolecules at very low resolution. The Few Atoms Model method". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 37-44.
    • E.Vernoslova & V.Lunin (1992). "FAN Scalar Field Analysis". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 35.
    • E.Vernoslova & V.Lunin.(1992). "CAN Comparative Analysis of three-dimensional Functions", Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 37.
    • Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1990). "New refinement program FROG gives new possibilities to study macromolecular models". Proc.of the First Intern. Meeting on Structure and Chemistry of Ribonucleases, Moscow, USSR, December 1989, 410-415.
    • Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Вернослова Е.А. (1989). "FROG - комплекс программ для локального уточнения атомной структуры макромолекул". В сб. “Компьютерные методы белковой инженерии”, Программное обеспечение ЭВМ, Институт математики, Институт биоорганической химии АН БССР, 86, 86-97, Минск.
    • Вазина А.А., Корыстова А.Ф., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Козлов М.А., Крайзман В.Л. & Лунин В.Ю. (1984). "Исследование металл-связывающих центров в тропонине, кальмодулине и парвальбумине с использованием EXAFS-спектров". Труды IV Всесоюзной конференции по использованию синхротронных источников, Новосибирск 1984, 250-254.

    Препринты, программные выпуски

    • Лунин В.Ю. (1994). "Математический аппарат рентгеноструктурного анализа макромолекул". Цикл лекций для магистрантов кафедры прикладной математики Пущинского Государственного Университета. Рукопись.
    • Lunin, V.Yu. (1991). "Use of the electron-density-syntheses histograms or solving of the phase problem in protein crystallography". Preprint, Pushchino Research Center, Pushchino, Russia.
    • Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Вернослова Е.А. (1988). "Комплекс программ FROG". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 10, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Лунин В.Ю. (1986). "Использование информации о распределении значений электронной плотности в белках. I. Восстановление недостающих структурных факторов". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Вернослова Е.А., Чиргадзе Ю.Н., Фоменкова Н.П., Невская Н.А. (1984). "Использование смешанной модели электронной плотности для улучшения набора фаз в белковой кристаллографии". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Лунин В.Ю. (1984). "Использование алгоритма быстрого дифференцирования в задаче уточнения значений фаз структурных факторов". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1983). "Конструирование программ для уточнения атомной структуры макромолекул на базе алгоритмов быстрого преобразования Фурье и быстрого дифференцирования". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Лунин В.Ю. (1983). "Рентгеноструктурный анализ белков. Проблемы расшифровки структуры". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Гаджиев А.М., Матюшин А.М., Вазина А.А., Ясенев М.Я., Шувалов Б.Н., Лунин В.Ю. (1983). "Программное обеспечение метода скоростной рентгеновской дифрaктометрии с высоким временным разрешением". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Лунин В.Ю. (1982). "Оптимизация расчета структурных факторов в кристаллографии белка". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Вернослов С.Е., Лунин В.Ю. (1982). "Некоторые алгоритмические вопросы обработки EXAFS-спектров". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Лунин В.Ю. (1982). "Использование метода максимального правдоподобия для оценки ошибок при определении фаз в кристаллографии белка". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю. (1982). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем уточнения модельной структуры. Улучшение набора фаз для g-кристаллина IIIb". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1981). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем уточнения модельной структуры. I. Описание метода". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Лунин В.Ю. (1979). "Комплекс программ "Быстрое преобразование Фурье". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 3, НЦБИ АН СССР, Пущино.
    • Лунин В.Ю. (1979). "Фазовая программа Тен Эйка". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 4, НЦБИ АН СССР, Пущино.

    Диссертации, авторефераты

    • Лунин В.Ю. (1992). "Использование статистических характеристик синтезов Фурье электронной плотности для решения фазовой проблемы в кристаллографии белка". Автореферат диссертации на соискание ученой степени д.ф.-м.н, ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.
    • Лунин В.Ю. (1992). "Использование статистических характеристик синтезов Фурье электронной плотности для решения фазовой проблемы в кристаллографии белка". Диссертация на соискание ученой степени д.ф.-м.н, ИК РАН, Москва.
    • Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейного эллиптического уравнения с малым параметром". Автореферат диссертация на соискание ученой степени кандидата ф.-м.н., МГУ, Москва.
    • Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейного эллиптического уравнения с малым параметром". Диссертация на соискание ученой степени кандидата ф.-м.н., МГУ, Москва.

    Тезисы конференций

    • Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2002). "Quadratic approximation of the maximum-likelihood criterion ". Acta Cryst., A58, S, C263 [Collected Abstracts, XIXth IUCr Congress & General Assembly, 6-15 August 2002, Geneve, Switzerland, 263].
    • Fokine, A., Lunina, N., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2002). "Bulk solvent and its role in macromolecular phasing". Acta Cryst., A58, S, C267 [Collected Abstracts, XIXth IUCr Congress & General Assembly, 6-15 August 2002, Geneve, Switzerland, 267].
    • Lunin, V.Y. (2002). "Determination of three-dimensional structure of biological macromolecules: mathematics and computers". V International Congress on Mathematical Modelling, September30-October 6, 2002, Dubna, Moscow Region, Book of Abstracts, Volume II, Joint Institute of Nuclear Research, Laboratory of Information Technologies, Council on mathematical modelling of RAS, Dubna 2002, 209.
    • Urzhumtsev, A., Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Podjarny, A. & Baumstark, M. (2002). "LDL particle : Direct structure determination ". Collected Abstracts, ACA Meeting, 25-30 May 2002, San Antonio, USA, 33.
    • Urzhumtsev, A., Lunina, N., Chabriere, E. & Lunin, V.Y. (2002). "Direct phasing in crystallography: connectivity of electron density maps". Z. Krist., Suppl. 19, 16. [Collected Abstracts, DGK Meeting, 4-7 March 2002, Kiel, Germany].
    • Urzhumtsev, A., Lunina, N.L. & Lunin, V.Y. (2002). "The connectivity-based choice in macromolecular low resolution ab-initio phasing". Acta Cryst., A58, S, C43 [Collected Abstracts, XIXth IUCr Congress & General Assembly, 6-15 August 2002, Geneve, Switzerland, 43].
    • Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (2001). "Phasage ab initio à basse résolution". AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de Cristallographie, Orsay, 3-6 juillet 2001, 95.
    • Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Simulation du critère de vraisemblance maximale par le critère de moindre carré". AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de Cristallographie, Orsay, 3-6 juillet 2001, 97.
    • Chabriere, E., Lunina, N., Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (2001). "Phasage ab initio par critères de connectivité: de la basse résolution aux structures secondaires". AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de Cristallographie, Orsay, 3-6 juillet 2001, 99.
    • Urzhumtsev, A., Podjarny, A. & Lunin, V.Y. (2001). "Ab initio phasing starting from low resolution". Euroconference on Phasing Biological Macromolecules (Phabio). Martina Franca – Italy, June 23-27, 2001, 4.35-4.40.
    • Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Maximum-likelihood refinement of atomic models using least-squares criterion". Euroconference on Phasing Biological Macromolecules (Phabio). Martina Franca – Italy, June 23-27, 2001, 4.47-4.51.
    • Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2001). "Maximum-likelihood refinement of atomic models using least squares criterion". ECM-20 Abstracts, XXth European Cryst.Meeting, 25-31 August 2001, Krakow, Poland, 148.
    • Chabriere, E., Lunina, N., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2001). "From low resolution to secondary structure elements". ECM-20 Abstracts, XXth European Cryst.Meeting, 25-31 August 2001, Krakow, Poland, 70.
    • Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Podjarny, A.D., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Baumstark, M.W. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Structure of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution: ab initio phasing methods for structure determination". ECM19 Satellite Meeting "Frontiers in macromolecular crystallography", Bishenberg, August, 31-September, 3, France, 31.
    • Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2000). "Maximal Likelihood refinement. It works, but why?". 19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st August 2000, Nancy, France, 201.
    • Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Maximal Likelihood refinement. It works, but why?". Acta Cryst., A56, S, S201.
    • Lunina, N., Lunin, V.Y., Podjarny, A., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Baumstark, M. & Urzhumtsev, A. (2000). "Structure of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution: structure determination and analysis". ECM19 Satellite Meeting “Frontiers in macromolecular crystallography”, Bishenberg, August, 31-September, 3, France, 32.
    • Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Use of map connectivity properties in macromolecular ab-initio phasing". 19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st August 2000 Nancy, France, 62.
    • Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Use of map connectivity properties in macromolecular ab-initio phasing". Acta Cryst., A56, S, S62.
    • Ritter, S., Lunina, N.L., Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D., Frey, I., Diederichs, K. & Baumstark, M.W. (2000). "Crystallizacion and structure determination of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution, using ab initio phases". 19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st August 2000 Nancy, France, 299.
    • Ritter, S., Lunina, N. L., Lunin, V. Y., Urzhumtsev, A. G., Podjarny, A.D., Frey, I., Diederichs, K. & Baumstark, M.W. (2000). "Crystallization and structure determination of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution, using ab initio phases". Acta Cryst., A, S, S299.
    • Urzhumtsev, A., Lunin, V.Y. & Lunina, N. (2000). "Density constraints and direct phasing". 19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st August 2000 Nancy, France, 108.
    • Urzhumtsev, A., Lunin, V.Y. & Lunina, N. (2000). "Density constraints and direct phasing". Acta Cryst. A56, S, S108.
    • Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A. & Lunin, V.Y. (2000). "Direct phasing at low resolution: current state and expectations". Millennium Symposium on Structural Biology, 26-29 March 2000, Heidelberg, Germany, Collected Abstracts, 103.
    • Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1999). "Low resolution phasing. Achievements and perspectives". XVIII Congress and General Assembly of IUCr, Glasgow, Scotland, UK, August 4-13, 1999. Collected Abstracts, 121.
    • Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (1999). "The connectivity-based choice in macromolecular low resolution ab-initio phasing". XVIII Congress and General Assembly of ICU, Glasgow, Scotland, UK, August 4-13, 1999. Collected Abstracts, 123.
    • Petrova, T.E., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (1999). "Ab-initio calculation of envelopes for macromolecules by maximization of likelihood". XVIII Congress and General Assembly of IUCr, Glasgow, Scotland, UK, August 4-13, 1999. Collected Abstracts, 183.
    • Urzhumtsev, A.G., N. & Lunin, V. (1999) "Proprietes Topologiques et Phasage Direct". GTBio-99, 12-15 Oct. 1999, Hourtin (Bordeaux, France), CO31.
    • Lunin, V.V., Lunin, V.Yu., Blagova, E.V., Shlyapnikov, S.V., Levdikov, V.M. & Mikhailov, A.M. (1998). "Serratia marcescens endonuclease refined structure of enzyme at 1.7A resolution and mechanism of its action". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (B), 473.
    • Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1998). "Very low resolution ab-initio phasing.Problems and advances". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (A), 131-132.
    • Lunina, N.L. (1998). "Software for very low resolution ab-initio phasing". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (B), 480-481.
    • Petrova, T.E., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (1998). "Likelihood base search of the centre of a macromolecular object". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (B), 481-482.
    • Podjarny, A.D., Lunina, N., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Petrova, T. & Lunin, V. (1998). "Ab-initio phasing at 30 A of the t50S ribosomal particle with the Few Atoms Model method". ACA Annual Meeting, Arlington, Virginia, July 18-23, 1998, 11.03.08, 74.
    • Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Petrova, T., Lunina, N. & Lunin, V. (1998). "Recent advances on the application of the few atom model method to the T50S ribosomal particle". Association Francaise de Cristallographie, AFC98, Orleans, 24-27 fevrier 1998, BCG-A02.
    • Skovoroda, T.P. & Lunin, V.Y. (1998). "Statistical properties of phase error estimates obtained on the bas marginal likelihood maximization". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (B), 482.
    • Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Y. & Lunina, N.L. (1998). "Seminvariant density decomposition and connectivity analysis in the low resolution macromolecular phasing". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (A), 482-483.
    • Lunin, V.Yu. (1997). "Likelihood Based Choice of Priors in Statistical Approaches to the Phase Problem". In Direct Methods for Solving Macromolecular Structures, Lecture Notes, Erice, 22 May-2 June 1997, 457.
    • Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1997). "A generalized likelihood and the phase cluster choice problem". In Direct methods for solving macromolecular structures, Lecture Notes, Erice, Italy, May 22 - June 02 1997, 485.
    • Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1997). "The use of generalized likelihood based approach in low-resolution ab-initio phasing". Seventeenth European Crystallographic Meeting, Collected abstracts, Lisboa - Portugal 24/28 August 1997, 53.
    • Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Podjarny, A,D. (1997). "Low Resolution Phasing: After First Images". Workshop "Validation and refinement of macromolecular structures", Abstracts, Porto, Portugal, August 29-30.
    • Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1997). "Statistical Properties of Phase Error Estimates Obtained on the Base of a Marginal Likelihood Maximization". Workshop "Validation and refinement of macromolecular structures", Abstracts, Porto, Portugal, August 29-30.
    • Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Поджарни А.Д. (1997). "Решение фазовой проблемы при низком разрешении в кристаллографии белка". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 212.
    • Иванов М.Е., Петрова Т.Е., Лунин В.Ю. (1997). "Приближение априорного распределения координат атомов в кристаллах макромолекул градиентом функции правдоподобия". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 218.
    • Лунина Н.Л., Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1997). "Выращивание плотности" - новый метод локального улучшения синтезов Фурье". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 222.
    • Сковорода Т.П., Лунин В.Ю. (1997). "Надежность показателей достоверности, определяемых на базе принципа максимума правдоподобия". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 225.
    • Лунин В.В., Лунин В.Ю., Благова Е.В., Левдиковspan> В.М., Шляпников С.В., Михайлов А.М. (1997). "Атомная структура молекулы эндонуклеазы Sm1 при разрешении 1.7 Ǻ". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 221.
    • Lunina, N.L. & Urzhumtsev, A. (1997). "Density growing: a new approach to the local improvement of electron density maps". XVIIth European Cryst.Meeting, 24-28 August 1997, Lisbon, Portugal, 92.
    • Lunin, V.Yu. (1996). "Low-resolution ab-initio phasing with Monte-Carlo and clusterization techniques". XVII Intern.Cryst.Congr., Seattle, USA, August 8-17, 1996, Coll.Abstr., C-63.
    • Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu., Vernoslova, E.A., Urzhumtseva, L.M. & Podjarny, A.D. (1995). "La methode FAM pour le phasage ab-initio: Applications". AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, BL15.
    • Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Lunina, N.L., Petrova, T.E. & Podjarny, A.D. (1995). "La methode FAM pour le phasage ab-initio: Theorie". AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, P07a.
    • Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1995). "R-free based maximum likelihood estimates of phase errors". 4th European Workshop on Crystallography of Biological Macromolecules, Como (Italy), May 21-25, O43.
    • Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "On the ab-initio solution of the phase problem for macromolecules at very low resolution: the Few Atoms Models method". 4th European Workshop on Crystallography of Biological Macromolecules, Como (Italy), May 21-25, O19.
    • Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu., Vernoslova, E.A., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Navaza, J. & Podjarny, A.D. (1994). "Very low resolution phasing with simple models". 15th Eur. Cryst. Meeting, Dresden, Germany, 28.8-2.9/1994, Coll.Abstr., R.Oldenbourg Verlag, Munchen, 217.
    • Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1994). "A Monte Carlo Approach to low resolution phasing in protein crystallography". ACA Annual Meeting, June 25 - July 1, 1994, INFORUM, Atlanta, Georgia, Atlanta Convention Center, 178.
    • Lunin, V.Yu. (1993). "Electron density histograms and the phase problem". Acta Cryst. A49, S MS-02.01.05.
    • Brazhnikov, E., Chirgadze, Yu., Ævarsson, A., Svensson, A. & Lunin, V. (1993). "The Similarity of results obtained by Solvent Flattening and Low-Resolution Phase retrieval for the Improvement of Protein Electron Density Map". 3rd European workshop on crystallography of biological macromolecules, Como (Italy), May 24-8 1993, M4.
    • Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Skovoroda, T.A. (1990). "Direct low-resolution phasing in protein crystallography". 16th Int.School on Crystallography, Erice, Italy, 18-29 April, 1990, Coll.Abstr.
    • Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Skovoroda, T.A. (1990). "Direct low-resolution phasing in protein crystallography". Acta Cryst., A46, S, C-113.
    • Chirgadze, Yu.N., Vernoslova, E.A., Nikonov, S.V., Sergeev, Yu.V., BrazhnikovE.V., Fomenkova, N.P., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1989). "Refined structure of calf lens γ-crystallin IIIb at 2.5A resolution". XIIth European Cryst. Meeting, Moscow, USSR, August 1989, Coll.Abstr., 2, 362.
    • Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1989). "FROG - new refinement program". XIIth European Cryst. Meeting, Moscow, USSR, August 1989, Coll.Abstr., 3, 193.
    • Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1989). "Frequency analysis - new approach to phase improvement in protein crystallography". XIIthEuropean Crystallographic Meeting, Moscow, USSR, August 1989, Coll.Abstr., 3, 146.
    • Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Luzyanina, T.B. (1986). "Macromolecular position determination with a noisy synthesis at low resolution". Xth European Cryst. Meeting, Wroclaw, Poland, Coll.Abstr., 1A-01, 51-52.
    • Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1984). "Molecular structure of calf lens protein γ-crystalline at 2.7A resolution". 16-th FEBS Conference, Moscow, 1984, Coll.Abstr, 232.
    • Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1984). "Program construction for refinement of the atomic structure of macromolecules based on the fast differentiation algorithm". Acta Cryst., A40, S, C-18.
    • Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Chirgadze, Yu.N., Fomenkova, N.P. & Nevskaya, N.A. (1984). "Structure of the calf lens protein gamma-crystallin III". Acta Cryst., A40, S, C-32.
    • Вазина А.А., Козлов М.А., Корыстова А.Ф., Крайзман В.Л., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Лунин В.Ю. (1982). "Методологические аспекты использования EXAFS-спектров для определения структуры белков". I Всесоюзный Биофизический Конгресс, Москва 1992, Сборник тезисов, III, 215.
    • Vazina, A.A., Kozlov, M.A., Korystova, A.F., Kraizman, V.L., Shelestov, V.M., Vernoslov, S.E. & Lunin V.Yu. (1982). "Methodological aspects of using EXAFS for protein structure determination". The First All-Union Congress on Biophysics, Moscow 1982, Coll.Abstr., III, 215.
    • Фоменкова Н.П., Чиргадзе Ю.Н., Сергеев Ю.В., Невская Н.А., Никонов С.В., Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1982). "Структура g-кристаллинов: функционирование, пространственная гомология доменов, функциональные группы". I Всесоюзный Биофизический Конгресс, Москва 1982, Сборник тезисов, 17.
    • Chirgadze, Yu.N., Sergeev, Yu.V., Fomenkova, N.P., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1981). "The structure γ-crystalline IIIb from calf lens". Acta Cryst., A37, S, C-40.
    • Чиргадзе Ю.Н., Орешин В.Д., Сергеев Ю.В., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Лунин В.Ю. (1980). "Структура гамма-кристаллинов II и IIIb из глазной линзы теленка при разрешении 5 Ǻ". V Всесоюзный Симпозиум по химии и физике белков и пептидов, Сборник тезисов, Баку 1980, 183.

    Работы по математике

    • Лунин В.Ю. (1978). "Об асимптотическом поведении решений первой краевой задачи для квазилинейных уравнений с частными производными, содержащих малый параметр". Труды конференции по уравнениям с частными производными памяти И.Г.Петровского, Москва, МГУ, 366-367.
    • Лунин В.Ю. (1977). "О финитности пограничного слоя в решениях некоторых классов задач, содержащих малый параметр". Успехи Матем.Наук, XXXII, в.1(193), 171-172.
    • Лунин В.Ю. (1977). "О равномерном приближении главным членом асимптотики решения первой краевой задачи для одного класса квазилинейных эллиптических уравнений" Вестник МГУ, Математика, Механика, 3, 46-57.
    • Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейных эллиптических уравнений второго порядка". <>Вестник МГУ, Математика, Механика, 3, 43-51.
    • Лунин В.Ю. (1976). "Построение главного члена асимптотики решения первой краевой задачи для одного класса квазилинейных эллиптических уравнений". Вестник МГУ, Математика, Механика, 5, 81-87.
    • Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейного эллиптического уравнения с малым параметром". Автореферат диссертация на соискание ученой степени кандидата ф.-м.н., МГУ, Москва.
    • Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейного эллиптического уравнения с малым параметром". Диссертация на соискание ученой степени кандидата ф.-м.н., МГУ, Москва.
    • Лунин В.Ю. (1974). "Оценки решений абстрактных параболических уравнений". Успехи Матем.Наук, т.XXIX, 3(177), 213-214.
    • Лунин В.Ю. (1973). "Оценки решений абстрактных параболических уравнений с нелинейными возмущениями". Вестник МГУ, Математика, Механика, 6, 56-63.
ИМПБ РАН © 1998-2024