Структура
Главная
События
Администрация
Структура
Достижения
Сотрудники
Публикации
Популярно о науке
Конференция ICMBB
История
Файловый архив
Ссылки
Контакты

Лаборатория кристаллографии макромолекул

Публикации

По состоянию на 01 января 2003

Внимание! Полные тексты статей, препринтов, диссертаций могут быть найдены здесь.

Статьи в журналах

  1. Lunin, V.Y., Afonine, P.V. & Urzhumtsev, A.G. (2002). "Likelihood-based refinement. I. Irremovable model errors". Acta Cryst. A58, 270–282.
  2. Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A. & Bockmayr, A. (2002). "Direct phasing by binary integer programming". Acta Cryst. A58, 283–291.
  3. Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Ritter, S., Frey, I., Berg, A., Diderichs, K., Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A. & Baumstark M.W. (2001). "Low-resolution data analysis for low-density lipoprotein particle". Acta Cryst., D57, 108-121.
  4. Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (2001). "Fast differentiation algorithm and efficient calculation of the exact matrix of second derivatives". Acta Cryst. A57, 451-460.
  5. Lunin , V.Y. (2000). "Fixed-scale wavelet-type approximation of periodic density distributions". Acta Cryst. A56, 73-84.
  6. Lunin, V.Y., Lunina, N.L. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Connectivity properties of high-density regions and ab initio phasing at low resolution". Acta Cryst. A56, 375-382.
  7. Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Skovoroda, T.P., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (2000). "Low-resolution ab initio phasing: problems and advances". Acta Cryst. D56, 1223-1232.
  8. Urzhumtsev, A.G., Lunina, N.L., Skovoroda, T.P., Podjarny, A.D. & Lunin, V.Y. (2000). "Density constraints and low-resolution phasing". Acta Cryst. D56, 1233-1244.
  9. Petrova, T.E., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (2000). "Ab initio low-resolution phasing in crystallography of macromolecules by maximization of likelihood". Acta Cryst. D56, 1245-1252.
  10. Shlyapnikov, S.V., Lunin, V.V., Perbandt, M., Polyakov, K.M., Lunin, V.Yu., Levdikov, V.M., Betzel, Ch.& Mikhailov, A.M.. (2000). "Atomic structure of the Serratia marcescens endonuclease at 1.1 A resolution and the enzyme reaction mechanism." Acta Cryst. D56, 567-572.
  11. Сковорода Т.П., Лунин В.Ю. (2000). "Надежность показателей достоверности, вычисляемых на базе принципа максимума правдоподобия". Кристаллография, 45, №2, 227-230.
  12. Lunin, V.Y., Lunina, N.L. & Urzhumtsev, A.G. (1999). "Seminvariant density decomposition and connectivity analysis and their application to very low resolution macromolecular phasing". Acta Cryst. A55, 916-925.
  13. Petrova, T.E., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (1999). "A likelihood-based search for the macromolecular position in the crystalline unit cell". Acta Cryst. A55, 739-745.
  14. Лунин В.Ю., Благова Е.В., Левдиков В.М., Лунин В.В., Шляпников С.В., Пербандт М., Райшанкар К.С., Бетзель Х., Михайлов А.М. (1999). "Внеклеточная эндонуклеаза. I. Пространственная структура белка в кристаллическом состоянии при разрешении 1.7А". Молекулярная биология, 33, 2, 214-222.
  15. Шляпников С.В., Благова Е.В., Левдиков В.М., Лунин В.Ю., Лунин В.В., Михайлов А.М., Бетзель Х., Райшанкар К.С., Пербандт М., (1999). "Внеклеточная эндонуклеаза. II. Аминокислотные остатки активного центра и гипотетический механизм функционирования фермента". Молекулярная биология, 33, 454-461.
  16. Петрова Т.Е., Лунин В.Ю., Лунина Н.Л., Сковорода Т.П. (1999). "Выбор априорного распределения координат атомов для макромолекулярных структур на основании принципа максимума правдоподобия". Биофизика, 44, 1, 22-26.
  17. Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1999). "Tcl/Tk based programs. III. CRITXPL: graphical analysis of the X-PLOR refinement log-files". J.Appl. Cryst.,32, 376-377.
  18. Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1998). "On the Ab initio solution of the Phase Problem for Macromolecules at Very Low Resolution. II. Generalized Likelihood Based Approach to Cluster Discrimination". Acta Cryst. D54, 726-734.
  19. Lunin, V.Yu., Levdikov, V.M., Shliapnikov, S.V., Blagova, E.V., Lunin, V.V., Wilson, K.S. & Mikhailov, A.M. (1997). "Three-dimensional structure of Serratia marcescens nuclease at 1.7 Ǻ resolution and mechanism of its action". FEBS Letters, 412, 217-222.
  20. Urzhumtsev, A., Tête-Favier, F., Mitschler, A., Barbanton, J., Barth, P., Urzhumtseva, L., Biellmann, J-F., Podjarny, A.D. & Moras, D. (1997). "A 'specificity' pocket inferred from the crystal structures of the complexes of aldose reductase with the pharmaceutically important inhibitors tolrestat and sorbinil". Structure, 5, 5, 601-612.
  21. Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1997). "Tcl/Tk-based programs. II. CONVROT: a program to recalculate different rotation descriptions". J.Appl.Cryst., 30, 402-410.
  22. Urzhumtsev, A.G. (1997). "Local improvement of electron density maps". Acta Cryst., D53, 540-543.
  23. Podjarny, A.D., Howard, E.I., Urzhumtsev, A.G. & Grigera, J.R. (1997). "A Multicopy Modeling of the Water Distribution in Macromolecular Crystals". Proteins, 28, 303-312.
  24. Lunin, V.Yu. & Lunina, N.L. (1996). "The Map Correlation Coefficient for Optimally Superposed Maps". Acta Cryst. A52, 365-368.
  25. Urzhumtsev, A.G., Skovoroda, T.P. & Lunin, V.Yu. (1996). "A procedure compatible with X-PLOR for the calculation of electron-density maps weighted using an R-free-likelihood-based approach". J.Appl.Cryst., 29, 741-744.
  26. Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A. & Podjarny, A.D. (1996). "Approaches to Very Low Resolution Phasing of the Ribosome 50S particle from Thermus thermophilus by the Few-Atoms-Models and Molecular-Replacement Methods". Acta Cryst., D52,1092-1097.
  27. Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1995). "R-free Likelihood-Based Estimates of Errors for Phases Calculated from Atomic Models". Acta Cryst. A51, 880-887.
  28. Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "On the ab-initio Solution of the Phase Problem for Macromolecules at Very Low Resolution: the Few Atoms Model Method". Acta Cryst., D51, 896-903.
  29. Navaza, J.& Vernoslova, E. (1995). "On the Fast Translation Functions for Molecular Replacement". Acta Cryst. A51, 445-449.
  30. Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "On the Solution of the Molecular Replacement Problem at Very Low Resolution: Application to Large Complexes". Acta Cryst., D51, 888-895.
  31. Tete-Favier, F., Barth, P., Mitchler, A., Podjarny, A.D., Rondeau, J.-M., Urzhumtsev, A., Biellmann, J.-F. & Moras, D. (1995). "Aldose Reductase from Pig Lens". European Journal of Medicinal Chemistry, 30, S, 589-603.
  32. Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1994). "Programs for translation searches with two independent models simultaneously". J.Appl.Cryst., 27, 122-124.
  33. Lunin, V.Yu. (1993). "Electron-Density Histograms and the Phase Problem". Acta Cryst. D49, 90-99.
  34. Vernoslova, E.A. & Lunin, V.Yu. (1993). "The FROG PC series: programs for electron-density and model investigation for proteins", J.Appl.Cryst., 26, 291-294.
  35. Lunin, V.Yu. & Woolfson, M.M. (1993). "Mean Phase Error and the Map Correlation Coefficient". Acta Cryst. D49, 530-533.
  36. Моргунова Е.Ю., Михайлов А.М., Уржумцев А.Г., Вайнштейн Б.К. (1992). "Строение капсида CMtV при разрешении 6А в кристаллическом состоянии". Кристаллография, 37, 2, 396-404.
  37. Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1991). "Frequency-Restrained Structure Factor Refinement. I. Histogram Simulation". Acta Cryst. A47, 45-52.
  38. Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1991). "Frequency-Restrained Structure Factor Refinement. II. Comparison of Methods". Acta Cryst. A47, 238-243.
  39. Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A., Vernoslova, E.A., Nikonov, S.V., Sergeev, Yu.V., Brazhnikov, E.V., Fomenkova, N.P., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1991). "Crystal structure of calf eye lens gamma-crystallin IIIb at 2.5A resolution: its relation to function". Experimental Eye Research, 53, 295-304.
  40. Чиргадзе Ю.Н., Бражников Е.В., Никонов С.В., Фоменкова Н.П., Гарбер М.Б., Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Чиргадзе Ю.Н., Некрасов Ю.В. (1991). "Кристаллическая структура рибосомного фактора G из бактерий Thermus Thermophilus при низком разрешении". Доклады АН СССР320, в.2, 488-491.
  41. Urzhumtsev, A.G. (1991). "How to calculate planarity restraints". Acta Cryst. A47, 723-727.
  42. Urzhumtsev, A.G. (1991). "Low-resolution phases: influence on SIR-syntheses and retrieval with double-step filtration". Acta Cryst. A47, 794-801.
  43. Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Skovoroda, T.A. (1990). "Direct low-resolution phasing from electron-density histograms in protein crystallography". Acta Cryst., A46, 540-544.
  44. Лобсанов Ю.Д., Плетнев В.З., Втюрин Н.Н., Лубнин М.Ю., Мокульский М.А., Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Лузянина Т.Б. (1990). "Рентгеноструктурные исследования комплекса лектина из гороха с углеводом при разрешении 2,4А. I. Биоорганическая химия, 16, 12б 1589-1598.
  45. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Luzyanina, T.B. (1989). "Bounding a Molecule in a Noisy Synthesis". Acta Cryst., A45, 34-39.
  46. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1989). "FROG - high-speed restraint-constraint refinement program for macromolecular structure". J.Appl.Cryst., 22, 500-506.
  47. Lunin, V.Yu. (1989). "The Calculation of the Second Moments for the Values of Fourier Syntheses with Random Structure Factors". Acta Cryst. A45, 501-505.
  48. Lunin, V.Yu. (1988). "Use of Information on Electron Density Distribution in Macromolecules". Acta Cryst A44, 144-150.
  49. Лунин В.Ю. (1988). "Восстановление недостающих структурных факторов при рентгеноструктурном исследовании макромолекул". Доклады АН СССР, 299, в.2, 363-366.
  50. Чиргадзе Ю.Н., Невская Н.А., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Сергеев Ю.В., Бражников Е.В., Гарбер М.Б., Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Вернослова Е.А. (1986). "Пространственная структура гамма-кристаллина IIIb из хрусталика глаза теленка при разрешении 2,5Ǻ". Доклады АН СССР, 290, 2, 492-495.
  51. Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A. & Fomenkova, N.P. (1985). "Phase Improvement in Protein Crystallography Using a Mixed Electron Density Model". Acta Cryst., A41, 166-171.
  52. Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1985). "Program construction for macromolecule atomic model refinement based on the fast Fourier transform and fast differentiation algorithms". Acta Cryst., A41, 327-333.
  53. Lunin, V.Yu. (1985). "Use of the Fast Differentiation Algorithm for Phase Refinement in Protein Crystallography". Acta Cryst. A41, 551-556.
  54. Вазина А.А., Корыстова А.Ф., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Лунин В.Ю., Козлов М.А., Крайзман В.Л. (1985). "Исследование структуры металлсвязывающих центров кальмодулина методом EXAFS-спектроскопии". Молекулярная биология, 19, в.6, 1643-1647.
  55. Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1984). "Improvement of Protein Phases by Coarse Model Modification". Acta Cryst., A40, 269-277.
  56. Вазина А.А., Корыстова А.Ф., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Лунин В.Ю., Козлов М.А., Крайзман В.Л. (1984). "Исследование Ca2+ -связывающих центров парвальбумина по дальней тонкой структуре рентгеновских спектров поглощения". Молекулярная биология, 18, в. 3, 681-684.
  57. Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1983). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем уточнения модельной структуры. I. Численные эксперименты". Кристаллография, 28, в.2, 310-315.
  58. Чиргадзе Ю.Н., Сергеев Ю.В., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Лунин В.Ю. (1980). "Определение структуры g-кристаллина II из глазной линзы теленка с разрешением 5Ǻ". Доклады АН СССР, 250, в.3, 762-765.
  59. Chirgadze, Yu.N., Oreshin, V.D., Sergeev, Yu.V., Nikonov, S.V. & Lunin, V.Yu. (1980). "Structure of gamma-crystallin IIIb from calf lens at 5A resolution". FEBS Letters, 118, 2, 296-298.

Статьи в сборниках

  1. Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A. & Bockmayr, A. (2002). "Direct phasing by Binary integer programming and its use for envelope determination". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 40 12.
  2. Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2002). "Search of the optimal strategy for refinement of atomic models". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 40 14.
  3. Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Podjarny A.D. (2002) "Retrieval of lost reflections in high resolution Fourier syntheses by a ‘soft’ solvent flattening". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 41 10.
  4. Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Maximum-likelihood refinement of atomic models using least-squares criterion". CCP4 Newsletter on protein crystallography, 39, 52-56.
  5. Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (2001). "Efficient calculation of the exact matrix of the second derivatives". CCP4 Newsletter on protein crystallography, 39, 60-67.
  6. Lunin, V.Y., Podjarny, A.D. & Urzhumtsev, A. (2001). "Low-resolution phasing in macromolecular crystallography". In : Advances in Structure Analysis, CSCA, Prague, Czech Republic, R.Kuzel & J.Hasek, eds., 4-36.
  7. Urzhumtsev, A., Podjarny, A. & Lunin, V.Y. (2001). "Ab initio phasing starting from low resolution". Invited article. Euroconference on Phasing, 23-27 June 2001, Martina Franca, Italy, 4.35-4.40.
  8. Lunin V.Y. & Urzhumtsev A.G. (1999). “Maximal Likelihood Refinement. It works, but why?", CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 37, 14-28.
  9. Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1998). "Programs Tcl/Tk based crystallographic software: current state and new programs". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 35, 22-24.
  10. Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. & Lunin, V.Y. (1998). "On density modification at very low resolution". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 35, 25-33.
  11. Lunin, V.Y. (1997). "The likelihood based choice of priors in statistical approaches to the phase problem". In Direct Methods for Solving Macromolecular Structures, ed. S.Fortier, NATO ASI Series C, Vol.507, 451-454.
  12. Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (1997). "Model based low resolution phasing". In Direct Methods for Solving Macromolecular Structures, ed. S.Fortier, NATO ASI Series C, Vol.507, 421-431.
  13. Urzhumtsev A.G., Lunin V.Yu. & Podjarny A.D. (1997). "Low resolution crystallographic images". In "Recent Advances in Phasing", ed. By K.S.W.Wilson, G.Davies, A.W.Ashton & S.Bailey, Proceedings of the CCP4 Study Weekend, University of York, 3-4 January, 1997, 207-214.
  14. Podjarny, A.D. & Urzhumtsev, A.G. (1997). "Low resolution phasing". In Methods in Enzymology, Academic Press, San Diego., C.W.Carter, Jr., R.M.Sweet, eds. 276A, 641-658.
  15. Urzhumtsev, A.G. (1996). "Density growing: a method for local improvement of electron density maps". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 32b, 36-39.
  16. Urzhumtsev, A.G. (1996). "Relations between some rotation descriptions for molecular replacement procedure". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 32b, 43-46.
  17. Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1996). "Tcl/Tk-based programs. I. CONFOR - user-friendly converter for crystallographic data files". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 32b, 40-42.
  18. Podjarny, A.D., Rees, B. & Urzhumtsev, A.G. (1996). "Density modification in X-ray crystallography". In Methods in Molecular Biology, 56: "Crystallographic Methods and Protocols", ed. C.Jones, B.Milloy, M.R.Sanderson, Totowa, New Jersey: Humana Press, 205-226.
  19. Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "On the problem of solvent modeling in macromolecular crystals using diffraction data: 1.The low-resolution range". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 31, 12-16.
  20. Volkmann, N., Schlünzen, F., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Podjarny, A.D., Roth, M., Pebay-Peyroula , E., Berkovitch-Yellin, Z., Zaytzev-Bashan, A. & Yonath, A. (1995). "On ab-initio phasing of ribosomal particles at very low resolution". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 31, 23-32.
  21. Ivanov, M.E. & Urzhumtsev, A.G. (1995). "FROG PC - a menu-based environment for atomic model refinement program on a personal computer". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 31, 20-22.
  22. Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1994). "On the ab-initio solution of the phase problem for macromolecules at very low resolution. The Few Atoms Model method". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 37-44.
  23. Vernoslova, E.A. & Urzhumtsev, A.G. (1994). "Current development in the program package FROG for atomic model refinement". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 27-28.
  24. Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. & Navaza, J. (1994). "On the solution of the molecular replacement problem at very low resolution". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 29-36.
  25. Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1994). "Published methods in crystallography. Reference database on personal computers". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 45-47.
  26. Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Navaza, J. (1994). "On the solution of the molecular replacement problem at very low resolution: application to a ribosome model crystal". ACA Transactions, 30, 109-120.
  27. Urzhumtsev, A.G. (1992). "On the reliability of atomic models in the PDB: stereochemical point of view". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 31-32.
  28. Vernoslova, E. & Lunin, V. (1992). "FAN Scalar Field Analysis", Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 35.
  29. Vernoslova, E. (1992). "FFT Discrete Three-Dimensional Fourier transform". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 36.
  30. Vernoslova, E. & Lunin, V. (1992). "CAN Comparative Analysis of three-dimensional Functions". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 37.
  31. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1990). "New refinement program FROG gives new possibilities to study macromolecular models". Proc.of the First Intern. Meeting on Structure and Chemistry of Ribonucleases, Moscow, USSR, December 1989, 410-415.
  32. Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Вернослова Е.А. (1989). "FROG - комплекс программ для локального уточнения атомной структуры макромолекул". В сб. "Компьютерные методы белковой инженерии", Программное обеспечение ЭВМ, Институт математики АН БССР, Институт биоорганической химии, 86, 86-97, Минск.
  33. Вазина А.А., Корыстова А.Ф., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Козлов М.А., Крайзман В.Л., Лунин В.Ю. (1984). "Исследование металл-связывающих центров в тропонине, кальмодулине и парвальбумине с использованием EXAFS -спектров". Труды IV Всесоюзной конференции по использованию синхротронных источников, Новосибирск 1984, 250-254.

Препринты, программные выпуски

  1. Лунин В.Ю. (1994). "Математический аппарат рентгеноструктурного анализа макромолекул". Цикл лекций для магистрантов кафедры прикладной математики Пущинского Государственного Университета. Рукопись.
  2. Lunin, V.Yu. style='mso-spacerun:yes'>  (1991). "Use of the electron-density-syntheses histograms or solving of the phase problem in protein crystallography". Preprint, Pushchino Research Center, Pushchino, Russia.
  3. Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Вернослова Е.А. (1988). "Комплекс программ FROG". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 10, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  4. Лунин В.Ю. (1986). "Использование информации о распределении значений электронной плотности в белках. I. Восстановление недостающих структурных факторов". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  5. Уржумцев А.Г. (1985). "Использование локального усреднения при анализе изображения макромолекул на картах распределения электронной плотности". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  6. Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Вернослова Е.А., Чиргадзе Ю.Н., Фоменкова Н.П., Невская Н.А. (1984). "Использование смешанной модели электронной плотности для улучшения набора фаз в белковой кристаллографии". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  7. Лунин В.Ю. (1984). "Использование алгоритма быстрого дифференцирования в задаче уточнения значений фаз структурных факторов". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  8. Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1983). "Конструирование программ для уточнения атомной структуры макромолекул на базе алгоритмов быстрого преобразования Фурье и быстрого дифференцирования". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  9. Лунин В.Ю. (1983) "Рентгеноструктурный анализ белков. Проблемы расшифровки структуры". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  10. Гаджиев А.М., Матюшин А.М., Вазина А.А., Ясенев М.Я., Шувалов Б.Н., Лунин В.Ю. (1983). "Программное обеспечение метода скоростной рентгеновской дифрaктометрии с высоким временным разрешением". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  11. Лунин В.Ю. (1982). "Оптимизация расчета структурных факторов в кристаллографии белка". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  12. Вернослов С.Е., Лунин В.Ю. (1982). "Некоторые алгоритмические вопросы обработки EXAFS-спектров". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  13. Лунин В.Ю. (1982). "Использование метода максимального правдоподобия для оценки ошибок при определении фаз в кристаллографии белка". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  14. Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю. (1982). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем уточнения модельной структуры. Улучшение набора фаз для g-кристаллина IIIb". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  15. Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1981). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем уточнения модельной структуры. I. Описание метода". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  16. Лунин В.Ю. (1979). "Комплекс программ "Быстрое преобразование Фурье". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 3, НЦБИ АН СССР, Пущино.
  17. Лунин В.Ю. (1979). "Фазовая программа Тен Эйка". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 4, НЦБИ АН СССР, Пущино.

Диссертации, авторефераты

  1. Петрова Т.Е. (2000). "Использование принципа максимального правдоподобия при решении фазовой проблемы в кристаллографии макромолекул". Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. Пущино.
  2. Петрова Т.Е. (2000). "Использование принципа максимального правдоподобия при решении фазовой проблемы в кристаллографии макромолекул". Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук, Пущино.
  3. Лунина Н.Л. (1998). "Вычислительные подходы к решению фазовой проблемы кристаллографии биополимеров при низком разрешении". Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.
  4. Лунина Н.Л. (1998). "Вычислительные подходы к решению фазовой проблемы кристаллографии биополимеров при низком разрешении". Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук, ИТЭБ РАН, Пущино.
  5. Вернослова Е.А. (1996). "Разработка и применение программного обеспечения для задач белковой кристаллографии". Автореферат диссертации на соискание ученой степени к.ф.-м.н., ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.
  6. Вернослова Е.А. (1996). "Разработка и применение программного обеспечения для задач белковой кристаллографии". Диссертация на соискание ученой степени к.ф.-м.н., Институт Кристаллографии РАН, Москва.
  7. Urzhumtsev, A. (1996). "Developpement de methodes et logiciels pour la determination de structures macromoleculaires par radiocristallographie. Applications e differents projets". Synthese d’activite scientifique, Strasbourg, 1996.
  8. Лунин В.Ю. (1992). "Использование статистических характеристик синтезов Фурье электронной плотности для решения фазовой проблемы в кристаллографии белка". Автореферат диссертации на соискание ученой степени д.ф.-м.н, ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.
  9. Лунин В.Ю. (1992). "Использование статистических характеристик синтезов Фурье электронной плотности для решения фазовой проблемы в кристаллографии белка". Диссертация на соискание ученой степени д.ф.-м.н, ИК РАН, Москва.
  10. Уржумцев А.Г. (1985). "Использование смешанной атомной модели для улучшения наборов фаз структурных факторов при рентгеноструктурном исследовании макромолекул". Автореферат диссертации на соискание ученой степени к.ф.-м.н, Институт Кристаллографии АН СССР, Москва.
  11. Уржумцев А.Г. (1985). "Использование смешанной атомной модели для улучшения наборов фаз структурных факторов при рентгеноструктурном исследовании макромолекул". Диссертация на соискание ученой степени к.ф.-м.н, Институт Кристаллографии АН СССР, Москва.
  12. Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейного эллиптического уравнения с малым параметром". Автореферат диссертация на соискание ученой степени кадидата ф.-м.н., МГУ, Москва.
  13. Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейного эллиптического уравнения с малым параметром". Диссертация на соискание ученой степени кадидата ф.-м.н., МГУ, Москва.

Тезисы конференций

  1. Afonine, P., Lunin, V. & Urzhumtsev, A. (2002). "Quadratic approximation of the maximum-likelihood criterion ". Acta Cryst., A58, S, C263 [Collected Abstracts, XIXth IUCr Congress & General Assembly, 6-15 August 2002, Geneve, Switzerland, 263]
  2. Fokine, A., Lunina, N., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2002). "Bulk solvent and its role in macromolecular phasing". Acta Cryst., A58, S, C267 [Collected Abstracts, XIXth IUCr Congress & General Assembly, 6-15 August 2002, Geneve, Switzerland, 267]
  3. Lunin, V.Y. (2002). "Determination of three-dimensional structure of biological macromolecules: mathematics and computers". V International Congress on Mathematical Modelling, September30-October 6, 2002, Dubna, Moscow Region, Book of Abstracts, Volume II, Joint Institute of Nuclear Research, Laboratori of Information Technologies, Council on mathematical modelling of RAS, Dubna 2002, 209.
  4. Lunina, N.L. (2002). "The use of connectivity properties of electron density distributions in determination of structures of biological macromolecules". V International Congress on Mathematical Modelling, September30-October 6, 2002, Dubna, Moscow Region, Book of Abstracts, Volume II, Joint Institute of Nuclear Research, Laboratori of Information Technologies, Council on mathematical modelling of RAS, Dubna 2002, 210.
  5. Urzhumtsev, A., Lunina, N., Chabriere, E. & Lunin, V.Y. (2002). "Direct phasing in crystallography: connectivity of electron density maps". Z. Krist., Suppl. 19, 16. [Collected Abstracts, DGK Meeting, 4-7 March 2002, Kiel, Germany].
  6. Urzhumtsev, A., Lunina, N.L. & Lunin, V.Y. (2002). "The connectivity-based choice in macromolecular low resolution ab-initio phasing". Acta Cryst., A58, S, C43 [Collected Abstracts, XIXth IUCr Congress & General Assembly, 6-15 August 2002, Geneve, Switzerland, 43]
  7. Urzhumtsev, A., Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Podjarny, A. & Baumstark, M. (2002). "LDL particle: Direct structure determination ". Collected Abstracts, ACA Meeting, 25-30 May 2002, San Antonio, USA, 33
  8. Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (2001). "Phasage ab initio à basse résolution". AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de Cristallographie, Orsay, 3-6 juillet 2001, 95.
  9. Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Simulation du critère de vraisemblance maximale par le critère de moindre carré". AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de Cristallographie, Orsay, 3-6 juillet 2001, 97.
  10. Chabriere, E., Lunina, N., Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (2001). "Phasage ab initio par critères de connectivité: de la basse résolution aux structures secondaires". AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de Cristallographie, Orsay,3-6 juillet 2001, 99.
  11. Podjarny, A., Joachimiak, A., Howard, E., Petrova, T., Chevrier, B., Sanishvili, R., Mitschler, A. & Moras, D. (2001). "Phasage MAD et SAD d'un complexe humain d'Aldose réductase-inhibiteur (AR, 36Kda) à 0,90 A de résolution", AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de Cristallographie, Orsay, 3-6 juillet 2001, 100.
  12. Urzhumtsev, A., Podjarny, A. & Lunin, V.Y. (2001). "Ab initio phasing starting from low resolution". Euroconference on Phasing Biological Macromolecules (Phabio). Martina Franca – Italy, June 23-27, 2001, 4.35-4.40.
  13. Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Maximum-likelihood refinement of atomic models using least-squares criterion". Euroconference on Phasing Biological Macromolecules (Phabio). Martina Franca – Italy, June 23-27, 2001, 4.47-4.51.
  14. Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2001). "Maximum-likelihood refinement of atomic models using least squares criterion". ECM-20 Abstracts, XXth European Cryst.Meeting, 25-31 August 2001, Krakow, Poland, 148.
  15. Chabriere, E., Lunina, N., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2001). "From low resolution to secondary structure elements". ECM-20 Abstracts, XXth European Cryst.Meeting, 25-31 August 2001, Krakow, Poland, 70.
  16. Joachimiak, A., Howard, E., Petrova, T., Chevrier, B., Sanishvili, R., Mitschler, A. & Podjarny, A. (2001). "The MAD Experiment at 0.9 A Producing Atomic Resolution Experimental Electron Density for 36 kDa Human Aldose Reductase". ECM-20 Abstracts, XXth European Cryst.Meeting, 25-31 August 2001, Krakow, Poland, 72.
  17. Lunin, V. V., Shlyapnikov, S.V., Perbandt, M., Betzel, Ch. & Mikhailov, A.M. (2000). "Magnesium-dependent Serratia marcescens endonuclease: three-dimensional structure at 1.1 Å resolution and molecular mechanism of enzyme action". Acta Cryst. A56, S, S280.
  18. Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Maximal Likelihood refinement. It works, but why?". Acta Cryst. A56, S, S201.
  19. Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Use of map connectivity properties in macromolecular ab-initio phasing". Acta Cryst. A56, S, S62
  20. Ritter, S., Lunina, N. L., Lunin, V. Y., Urzhumtsev, A. G., Podjarny, A.D., Frey, I., Diederichs, K. & Baumstark, M.W. (2000). "Crystallization and structure determination of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution, using ab initio phases". Acta Cryst. A56, S, S299.
  21. Urzhumtsev, A., Lunin, V.Y. & Lunina, N. (2000). "Density constraints and direct phasing". Acta Cryst. A56, S, S108
  22. Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Use of map connectivity properties in macromolecular ab-initio phasing". 19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st August 2000 Nancy, France, 62.
  23. Urzhumtsev, A., Lunin, V.Y. & Lunina, N. (2000). "Density constraints and direct phasing". 19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st August 2000 Nancy, France, 108.
  24. Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2000). "Maximal Likelihood refinement. It works, but why?". 19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st August 2000 Nancy, Franc, 201.
  25. Ritter, S., Lunina, N.L., Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D., Frey, I., Diederichs, K. & Baumstark, M.W. (2000). "Crystallizacion and structure determination of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution, using ab initio phases". 19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st August 2000 Nancy, France, 299.
  26. Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Podjarny, A.D., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Baumstark, M.W. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Structure of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution: ab initio phasing methods for structure determination". ECM19 Satellite Meeting "Frontiers in macromolecular crystallography", Bishenberg, August, 31-September, 3, France, 31.
  27. Lunina, N., Lunin, V.Y., Podjarny, A., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Baumstark, M. & Urzhumtsev, A. (2000). "Structure of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution: structure determination and analysis". ECM19 Satellite Meeting "Frontiers in macromolecular crystallography", Bishenberg, August, 31-September, 3, France, 32.
  28. Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A. & Lunin, V.Y. (2000). "Direct phasing at low resolution: current state and expectations". Millenium Symposium on Structural Biology, 26-29 March 2000, Heidelberg, Germany, Collected Abstracts, 103.
  29. Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1999). "Low resolution phasing. Achievements and perspectives". XVIII Congress and General Assembly of IUCr, Glasgow, Scotland, UK, August 4-13, 1999. Collected Abstracts, 121.
  30. Petrova, T.E., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (1999). "Ab-initio calculation of envelopes for macromolecules by maximization of likelihood". XVIII Congress and General Assembly of IUCr, Glasgow, Scotland, UK, August 4-13, 1999. Collected Abstracts, 183.
  31. Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (1999). "The connectivity-based choice in macromolecular low resolution ab-initio phasing". XVIII Congress and General Assembly of ICU, Glasgow, Scotland, UK, August 4-13, 1999. Collected Abstracts, 123.
  32. Urzhumtsev, A.G., Lunina, N. & Lunin, V. (1999) "Proprietes Topologiques et Phasage Direct". GTBio-99, 12-15 Oct. 1999,Hourtin (Bordeaux, France), CO31.
  33. Lunin, V.V., Lunin, V.Yu., Blagova, E.V., Shlyapnikov, S.V., Levdikov, V.M. & Mikhailov, A.M. (1998). "Serratia marcescens endonuclease refined structure of enzyme at 1.7A resolution and mechanism of its action". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (B), 472-473.
  34. Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1998). "Very low resolution ab-initio phasing. Problems and advances". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (A), 131-132.
  35. Lunina, N.L. (1998). "Software for very low resolution ab-initio phasing". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (B), 480-481.
  36. Petrova, T.E., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (1998). "Likelihood base search of the center of a macromolecular object". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (B), 481-482.
  37. Podjarny, A.D., Lunina, N., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Petrova, T. & Lunin, V. (1998). "Ab-initio phasing at 30 A of the t50S ribosomal particle with the Few Atoms Model method". ACA Annual Meeting, Arlington, Virginia, July 18-23, 1998, 11.03.08, 74.
  38. Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Petrova, T., Lunina, N. & Lunin, V. (1998). "Recent advances on the application of the few atom model method to the T50S ribosomal particle". Association Francaise de Cristallographie, AFC98, Orleans, 24-27 fevrier 1998, BCG-A02.
  39. Skovoroda, T.P. & Lunin, V.Y. (1998). "Statistical properties of phase error estimates obtained on the bas marginal likelihood maximization". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (B), 482.
  40. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Y. & Lunina, N.L. (1998). "Seminvariant density decomposition and connectivity analysis in the low resolution macromolecular phasing". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (A), 482-483
  41. Lunin, V.Yu. (1997). "Likelihood Based Choice of Priors in Statistical Approaches to the Phase Problem". In Direct Methods for Solving Macromolecular Structures, Lecture Notes, Erice, 22 May-2 June 1997, 457.
  42. Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1997). "A generalized likelihood and the phase cluster choice problem". In Direct methods for solving macromolecular structures, Lecture Notes, Erice, Italy, May 22 - June 02 1997, 485.
  43. Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1997). "The use of generalized likelihood based approach in low-resolution ab-initio phasing". Seventeenth European Crystallographic Meeting, Collected abstracts, Lisboa - Portugal 24/28 August 1997, 53.
  44. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Podjarny, A,D. (1997). "Low Resolution Phasing: After First Images". Workshop "Validation and refinement of macromolecular structures", Abstracts, Porto, Portugal, August 29-30.
  45. Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1997). "Statistical Properties of Phase Error Estimates Obtained on the Base of a Marginal Likelihood Maximization". Workshop "Validation and refinement of macromolecular structures", Abstracts, Porto, Portugal, August 29-30.
  46. Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Поджарни А.Д. (1997). "Решение фазовой проблемы при низком разрешении в кристаллографии белка". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 212.
  47. Иванов М.Е., Петрова Т.Е., Лунин В.Ю. (1997). "Приближение априорного распределения координат атомов в кристаллах макромолекул градиентом функции правдоподобия". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 218.
  48. Лунина Н.Л., Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1997). "Выращивание плотности" - новый метод локального улучшения синтезов Фурье". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 222.
  49. Сковорода Т.П., Лунин В.Ю. (1997). "Надежность показателей достоверности, определяемых на базе принципа максимума правдоподобия". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 225.
  50. Лунин В.В., Лунин В.Ю., Благова Е.В., Левдиков В.М., Шляпников С.В., Михайлов А.М. (1997). "Атомная структура молекулы эндонуклеазы Sm 1 при разрешении 1.7 Ǻ". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 221.
  51. Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A., Tete-Favier, F., Mitschler, A., Barbanton, J., Barth, P., Urzhumtseva, L., Biellmann, J.-F. & Moras, D. (1997). "The crystal structure of the complexes of aldose reductase with the inhibitors tolrestat and sorbinil". XVIIth European Cryst.Meeting, 24-28 August 1997, Lisbon, Portugal, 14.
  52. Urzhumtsev, A. & Urzhumtseva, L. (1997). "New interactive tcl/tk-based software for macromolecular crystallographers". XVIIth European Cryst.Meeting, 24-28 August 1997, Lisbon, Portugal, 184.
  53. Lunina, N.L. & Urzhumtsev, A. (1997). "Density growing: a new approach to the local improvement of electron density maps". XVIIth European Cryst.Meeting, 24-28 August 1997, Lisbon, Portugal, 92.
  54. Lunin, V.Yu. (1996). "Low-resolution ab-initio phasing with Monte-Carlo and clusterization techniques". XVII Intern.Cryst.Congr., Seattle, USA, August 8-17, 1996, Coll.Abstr., C-63.
  55. Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D., Mitschler, A., Tete-Favier, F., Barth, P., Biellmann, J.-F. & Moras, D. (1996). "Etudes cristallographiques des complexes de l’aldose reductase et ses inhibiteurs". Les Cahiers IMABIO, HS, 4, 82.
  56. Howard, E.I., Grigera, J.R., Podjarny, A.D. & Urzhumtsev A.G. (1996). "Multicopy modeling of the solvent distribution in macromolecular crystals". XVII Intern.Cryst.Congr., Seattle, USA, August 8-17, 1996, Coll.Abstr., C-86
  57. Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Vernoslova, E.A. (1996). "Very low resolution phasing attempts of the ribosome 50S particle from T. thermophilus by the Few Atoms Model method". XVII Intern.Cryst.Congr., Seattle, USA, August 8-17, 1996, Coll.Abstr., C-67
  58. Grigera, J.R., Howard, E.I., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1996). "Hydration of biomacromolecules by multicopy molecular dynamics with diffraction constraints. Bringing into agreement diffraction and NMR data". Intern.Biophysics Congr. IUPAB, Amsterdam, the Netherlands, 1996, Coll.Abstr.
  59. Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G., Howard, E.I. & Grigera, J.R. (1996). "Modelisation multicopie de la distribution du solvant dans les cristaux macromol culaires". AFC96, 10-13 Sept. 1996, Toulouse, 42.
  60. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu., Vernoslova, E.A., Urzhumtseva, L.M. & Podjarny, A.D. (1995). "La methode FAM pour le phasage ab-initio: Applications". AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, BL15.
  61. Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Lunina, N.L., Petrova, T.E. & Podjarny, A.D. (1995). "La methode FAM pour le phasage ab-initio: Theorie". AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, P07a.
  62. Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1995). "R-free based maximum likelihood estimates of phase errors". 4th European Workshop on Crystallography of Biological Macromolecules, Como (Italy), May 21-25, O43.
  63. Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "On the ab-initio solution of the phase problem for macromolecules at very low resolution: the Few Atoms Models method". 4th European Workshop on Crystallography of Biological Macromolecules, Como (Italy), May 21-25, O19.
  64. Podjarny, A.D. & Urzhumtsev, A.G. (1995). "Le remplacement moleculaire a tres basse resolution". AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, BL08.
  65. Zagari, A., Sica, F., Vitagliano, L., Scarano, G., Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. & Bocchini, V. (1995). "Cristallisation et analyse preliminaire par rayons X du facteur d’elongation hyperthermophile EF 1alpha". AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, P43.
  66. Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "Very low resolution molecular replacement with envelope models". 4th European Workshop on Crystallography of Biological Macromolecules, Como (Italy), May 21-25, A04.
  67. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu., Vernoslova, E.A., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Navaza, J. & Podjarny, A.D. (1994). "Very low resolution phasing with simple models". 15th Eur. Cryst. Meeting, Dresden, Germany, 28.8-2.9/1994, Coll.Abstr., R.Oldenbourg Verlag, Munchen, 217
  68. Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & "A Monte Carlo Approach to low resolution phasing in protein crystallography". ACA Annual Meeting, June 25 - July 1, 1994, INFORUM, Atlanta, Georgia, Atlanta Convention Center, 178
  69. Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Navaza, J. (1994). "On the solution of the molecular replacement problem at very low resolution: application to a ribosome model crystal". ACA Annual Meeting, June 25 - July 1, 1994, INFORUM, Atlanta, Georgia, Atlanta Convention Center, 40.
  70. Lunin, V.Yu. (1993). "Electron density histograms and the phase problem". Acta Cryst. A49, S MS-02.01.05.
  71. Brazhnikov, E., Chirgadze, Yu., Ævarsson, A., Svensson, A. & Lunin, V. (1993). "The Similarity of results obtained by Solvent Flattening and Low-Resolution Phase retrieval for the Improvement of Protein Electron Density Map". 3rd European workshop on crystallography of biological macromolecules, Como (Italy), May 24-8 1993, M4.
  72. Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1993). "Enveloppes moleculaires modulées en fonction de la distance au bord". Reunion francophone de cristallographie de macromolécules", Ste Odile (Strasbourg), 2-5 Juin 1993, P1
  73. Urzhumtsev, A.G., Podjarny,A.D., Cavarelli, J., Rees, B., Giege, R., Thierry, J.-C. & Moras, D. (1992). "Low-resolution phasing of the cubic form of the aspartyl tRNA synthetase complex confirmed by molecular replacement results". Journees Annuelles de l’Association Francaise de Cristallographie; Paris, 5-7 Mai 1992, Ministere de la Recherche et de l’Espace, II-21
  74. Urzhumtsev, A.G. (1992). "PDB models: errors in stereochemistry". XIVth Eur. Cryst. Meeting, 2-7 August 1992, Enschede, The Netherlands, 234
  75. Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G., Cavarelli, J., Rees, B., Giege, R., Thierry, J.-C. & Moras, D. (1992). "The low-resolution structure of the cubic form of the aspartyl tRNA synthetase complex: comparison of molecular replacement results and previous ab-initio low-resolution phasing". XIVth Eur. Cryst. Meeting, 2-7 August 1992, Enschede, The Netherlands, 245
  76. Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1993). "Envelopes moleculaires modulees en fonction de la distance au bord". Reunion francophone de cristallographie de macromolecules, Ste Odile (Strasbourg), 205 Juin 1993, P1
  77. Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Skovoroda, T.A. (1990). "Direct low-resolution phasing in protein crystallography". 16th Int.School on Crystallography, Erice, Italy, 18-29 April, 1990, Coll.Abstr.
  78. Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Skovoroda, T.A. (1990). "Direct low-resolution phasing in protein crystallography". Acta Cryst., A46, S, C-113.
  79. Urzhumtsev, A.G. (1990). "Molecular bounding by two step filtration of SIR-synthesis". Acta Cryst., A46, S, C-114.
  80. Morgunova, E.Yu., Urzhumtsev, A.G., Mikhailov, A.M. & Vainstein, B.K. (1990). "The CMtV capsid protein structure at 6A resolution". Acta Cryst., A46, S, C87-88.
  81. Chirgadze, Yu.N., Vernoslova, E.A., Nikonov, S.V., Sergeev, Yu.V., Brazhnikov, E.V., Fomenkova, N.P., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1989). "Refined structure of calf lens g-crystallin IIIb at 2.5A resolution". XIIth European Cryst. Meeting, Moscow, USSR, August 1989, Coll.Abstr., 2, 362.
  82. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1989). "FROG - new refinement program". XIIth European Cryst. Meeting, Moscow, USSR, August 1989, Coll.Abstr., 3, 193.
  83. Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1989). "Frequency analysis - new approach to phase improvement in protein crystallography". XIIth European Crystallographic Meeting, Moscow, 1989, Coll.Abstr., 3, 146.
  84. Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A., Urzhumtsev, A.G. & Vernoslova, E.A. (1989). "Structure refinement of "dry" form of calf lens γ-crystallin IIIb at 1.9A resolution". XIIth European Cryst. Meeting, Moscow, USSR, August 1989, Coll.Abstr., 2, 363.
  85. Murzin A.G. & Vernoslova E.A. (1988). "Computer modeling of protein hybrids: phage T4 lysozime with a Ca2+ - binding module (FE-hand)". V conference of young scientist of socialist countries on Bioorganic Chemistry, Abstracts, Pushchino (USSR), 83-84.
  86. Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Luzyanina, T.B. (1986). "Macromolecular position determination with a noisy synthesis at low resolution". Xth European Cryst. Meeting, Wroclaw, Poland, Coll.Abstr., 1A-01, 51-52.
  87. Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1984). "Molecular structure of calf lens protein γ-crystalline at 2.7A resolution". 16-th FEBS Conference, Moscow, 1984, Coll.Abstr., 232.
  88. Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1984). "Program construction for refinement of the atomic structure of macromolecules based on the fast differentiation algorithm". Acta Cryst., A40, S, C-18.
  89. Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Chirgadze, Yu.N., Fomenkova, N.P. & Nevskaya, N.A. (1984). " Crystal structure of the calf lens protein gamma-crystallin III". Acta Cryst., A40, S, C-32.
  90. Кузин А.П., Уржумцев А.Г. (1983). "Уточнение кристаллической структуры актиноксантина при разрешении 1,8А МНК в обратном пространстве". VI Всесоюзный симпозиум по химии белков и пептидов, Рига, ноябрь 1983, Тезисы докладов, 186.
  91. Вазина А.А., Козлов М.А., Корыстова А.Ф., Крайзман В.Л., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Лунин В.Ю. (1982). "Методологические аспекты использования EXAFS-спектров для определения структуры белков". I Всесоюзный Биофизический Конгресс, Москва 1992, Сборник тезисов, III, 215.
  92. Vazina, A.A., Kozlov, M.A., Korystova, A.F., Kraizman, V.L., Shelestov, V.M., Vernoslov, S.E. & Lunin V.Yu. (1982). "Methodological aspects of using EXAFS for protein structure determination". The First All-Union Congress on Biophysics, Moscow, 1982, Coll.Abstr., III, 215.
  93. Фоменкова Н.П., Чиргадзе Ю.Н., Сергеев Ю.В., Невская Н.А., Никонов С.В., Лунин В.Ю., "Структура g-кристаллинов: функционирование, пространственная гомология доменов, функциональные группы". I Всесоюзный Биофизический Конгресс, Москва 1992, Сборник тезисов, 17.
  94. Chirgadze, Yu.N., Sergeev, Yu.V., Fomenkova, N.P., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1981). "The structure γ-crystalline IIIb from calf lens". Acta Cryst., A37, S, C-40
  95. Чиргадзе Ю.Н., Орешин В.Д., Сергеев Ю.В., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Лунин В.Ю. (1980). "Структура гамма-кристаллинов из глазной линзы теленка при разрешении 5 Ǻ". Симпозиум по химии и физике белков и пептидов, Сборник тезисов, Баку 1980, 183.
ИМПБ РАН © 1998-2024